RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LMAN1P49257 510 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FNTAP49354 379 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GDF10P55107 478 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DMPKQ09013 629 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NFATC2Q13469 925 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RTP5Q14D33 572 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTPRRQ15256 657 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SKIDA1Q1XH10 827 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC157Q569K6 752 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WASH2PQ6VEQ5 465 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RFLNAQ6ZTI6 216 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNX20Q7Z614 316 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC9B2Q86UD5 537 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NRROSQ86YC3 692 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 REXO1L1PQ8IX06 675 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SFRP1Q8N474 314 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GDAP1Q8TB36 358 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACTRT1Q8TDG2 376 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C1orf54Q8WWF1 131 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM74Q96NL1 305 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RANBP9Q96S59 729 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TTC1Q99614 292 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM118BQ9BPY3 351 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC3Q9BQI4 270 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR2AG1Q9H205 316 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UCK1Q9HA47 277 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WASH6PQ9NQA3 447 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATXN10Q9UBB4 475 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GULP1Q9UBP9 304 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa8.47□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.46□□□□□ -1.05
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A0U1RQS6 177 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RHPN2P1A8MT19 583 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 D6RAR5 112 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AURKAO14965 403 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SRP72O76094 671 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 METTL18O95568 372 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TPSB2P20231 275 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IDSP22304 550 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCKBRP32239 447 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EPHA4P54764 986 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SQSTM1Q13501 440 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CAMK2BQ13554 666 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TPSAB1Q15661 275 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CYP1B1Q16678 543 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 INSCQ1MX18 579 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AGAP9Q5VTM2 703 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC30A9Q6PML9 568 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM151BQ6UXP7 276 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GSTA5Q7RTV2 222 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPRED1Q7Z699 444 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM74Q86UV6 250 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCNJLQ8IV13 435 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DNAAF3Q8N9W5 541 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR4K2Q8NGD2 314 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF398Q8TD17 642 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SGSM3Q96HU1 749 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RUNDC3BQ96NL0 473 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STRADBQ9C0K7 418 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C10orf88Q9H8K7 445 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCND1Q9NSA2 647 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POT1Q9NUX5 634 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SIRPGQ9P1W8 387 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRIT1Q9P2V4 623 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNF14Q9UBS8 474 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CRLS1Q9UJA2 301 aa8.46□□□□□ -1.06
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNX12Q9UMY4 172 aa8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms