RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 MYBPC1Q00872 1141 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 RALGDSQ12967 914 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 APOFQ13790 326 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 CYTH1Q15438 398 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 RTP2Q5QGT7 225 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 HECTD3Q5T447 861 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 SLC8B1Q6J4K2 584 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 MDGA1Q8NFP4 955 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 LRTOMTQ8WZ04 291 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 TUBGCP3Q96CW5 907 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 BIRC8Q96P09 236 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 NPPAP01160 153 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 RHOCP08134 193 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 PIRTP0C851 137 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 HGFP14210 728 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 SCNN1BP51168 640 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 XKR7Q5GH72 579 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 PPP4R4Q6NUP7 873 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 DDIASQ8IXT1 998 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 HERVK_113Q902F9 699 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 KCNJ9Q92806 393 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 COQ10BQ9H8M1 238 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 ACTR3BQ9P1U1 418 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 NR5A2O00482 541 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 GALTP07902 379 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 RGRP47804 291 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 FOXA1P55317 472 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 BPTFQ12830 3046 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 GRB7Q14451 532 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 INPP5AQ14642 412 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 RPS6KA2Q15349 733 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 PTPRNQ16849 979 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 UGT3A1Q6NUS8 523 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 ERMP1Q7Z2K6 904 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 SPNS2Q8IVW8 549 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 HOMEZQ8IX15 550 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 SLC15A3Q8IY34 581 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 STK40Q8N2I9 435 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 GALNT4Q8N4A0 578 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 GIPC2Q8TF65 315 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 SLC45A3Q96JT2 553 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 CNBD2Q96M20 576 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 GPR21Q99679 349 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 GDF15Q99988 308 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 SPON2Q9BUD6 331 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 BRINP2Q9C0B6 783 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 AIG1Q9NVV5 245 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 BACE2Q9Y5Z0 518 aa23.58■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 A0A1W2PP18 115 aa23.58■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 ZNF840PA6NDX5 716 aa23.58■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD66B4E2M5 251 aa23.58■■□□□ 1.36
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PMS1-205ENST00000409985 NME4O00746 187 aa23.58■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 CAPN3P20807 821 aa23.58■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
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PMS1-205ENST00000409985 C6orf52Q5T4I8 152 aa23.58■■□□□ 1.36
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PMS1-205ENST00000409985 OR56A4Q8NGH8 313 aa23.58■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 B3GALT6Q96L58 329 aa23.58■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 NSMCE3Q96MG7 304 aa23.58■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 PCTPQ9UKL6 214 aa23.58■■□□□ 1.36
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PMS1-205ENST00000409985 C7P10643 843 aa23.57■■□□□ 1.36
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PMS1-205ENST00000409985 SHHQ15465 462 aa23.57■■□□□ 1.36
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PMS1-205ENST00000409985 PRR23BQ6ZRT6 265 aa23.57■■□□□ 1.36
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PMS1-205ENST00000409985 RAI2Q9Y5P3 530 aa23.57■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 SNX13Q9Y5W8 968 aa23.57■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 LRRC14BA6NHZ5 514 aa23.56■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA8CPA6NN73 597 aa23.56■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 CRCPO75575 148 aa23.56■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 LATS1O95835 1130 aa23.56■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 EFEMP2O95967 443 aa23.56■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 RCAN2Q14206 197 aa23.56■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 ADGRF1Q5T601 910 aa23.56■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 LAYNQ6UX15 382 aa23.56■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 SATL1Q86VE3 508 aa23.56■■□□□ 1.36
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