RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 E7ESA3 106 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 H7C0C1 242 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 DCLK1O15075 740 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CCL16O15467 120 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 MTSS1O43312 755 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 OPHN1O60890 802 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ECI2O75521 394 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SPAG6O75602 509 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TCEA3O75764 348 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TTC4O95801 387 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ALDH2P05091 517 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SLC2A3P11169 496 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 GOT1P17174 413 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TPSB2P20231 275 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 AOAHP28039 575 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 HOXA6P31267 233 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CCR1P32246 355 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ADRA1BP35368 520 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CHKAP35790 457 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ATP5OP48047 213 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 GLUD2P49448 558 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ARL4CP56559 192 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CREMQ03060 361 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 GBE1Q04446 702 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ZNF33AQ06730 810 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 NME3Q13232 169 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 KCNJ11Q14654 390 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TPSAB1Q15661 275 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 KRT71Q3SY84 523 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 EMC10Q5UCC4 262 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SYPL2Q5VXT5 272 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 BSPRYQ5W0U4 402 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 KDM7AQ6ZMT4 941 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TADA2BQ86TJ2 420 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 MON1AQ86VX9 555 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CCDC25Q86WR0 208 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CFHR4Q92496 578 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CPT1BQ92523 772 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 DNASE1L2Q92874 299 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TMEM9BQ9NQ34 198 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 IL37Q9NZH6 218 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 FBXO10Q9UK96 956 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PIAS3Q9Y6X2 628 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PTPRBP23467 1997 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 FLNCQ14315 2725 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 C5orf60A6NFR6 353 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 KCNN4O15554 427 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 GCATO75600 419 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TMEM63AO94886 807 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 AGTP01019 485 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 APOEP02649 317 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 OR4Q2P0C623 313 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 NR1D1P20393 614 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PHBP35232 272 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 RPL22P35268 128 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 FDFT1P37268 417 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 IRX4P78413 519 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 BASP1P80723 227 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 DSG1Q02413 1049 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CREB5Q02930 508 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 GALNT2Q10471 571 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SEMA5AQ13591 1074 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 STAT4Q14765 748 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 RASA2Q15283 850 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TERF2Q15554 542 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PSMD5Q16401 504 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TBR1Q16650 682 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 USP41Q3LFD5 358 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 MANEALQ5VSG8 457 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TPGS2Q68CL5 300 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms