RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 OR4K2Q8NGD2 314 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 VPS35Q96QK1 796 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 RDH14Q9HBH5 336 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 KLC4Q9NSK0 619 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC23A2Q9UGH3 650 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 FKBPLQ9UIM3 349 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF148Q9UQR1 794 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 RP1P56715 2156 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 C2orf81A6NN90 581 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 CCL22O00626 93 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 PNLIPP16233 465 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 LPOP22079 712 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 CXCR5P32302 372 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 B4GALNT1Q00973 533 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 PEX6Q13608 980 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 OASLQ15646 514 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 INSCQ1MX18 579 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 NKAIN2Q5VXU1 208 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 C19orf48Q6RUI8 117 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 MICALCLQ6ZW33 695 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC37A2Q8TED4 501 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 NAT14Q8WUY8 206 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 TLR10Q9BXR5 811 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 PRDM8Q9NQV8 689 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 PKD1L2Q7Z442 2459 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 CHUKO15111 745 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 VEGFDO43915 354 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 PRAMEF1O95521 474 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 ETS1P14921 441 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 LSSP48449 732 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 INHBCP55103 352 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 NFATC2Q13469 925 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 P3H1Q32P28 736 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 MAP9Q49MG5 647 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 KCTD11Q693B1 232 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF438Q7Z4V0 828 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 LRRTM4Q86VH4 590 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF547Q8IVP9 402 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 SFRP1Q8N474 314 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 TRIM58Q8NG06 486 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 OR13C4Q8NGS5 318 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 LRRC45Q96CN5 670 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 TTC25Q96NG3 672 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 KMOO15229 486 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 CEP104O60308 925 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 CRTAMO95727 393 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 FGGP02679 453 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 GTF2H3Q13889 308 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 SEPT6Q14141 434 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 GPRC6AQ5T6X5 926 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 IYDQ6PHW0 289 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 DET1Q7L5Y6 550 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF398Q8TD17 642 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 BRSK1Q8TDC3 778 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 RTP4Q96DX8 246 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 LRRC40Q9H9A6 602 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 ACACAQ13085 2346 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 MYLKQ15746 1914 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC78A2IDD5 438 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 A6NCN8 305 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 OR2AG2A6NM03 316 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 PDZK1P1A8MUH7 402 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 GPR89AB7ZAQ6 455 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 PPFIA2O75334 1257 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 GPR89BP0CG08 455 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 HGFP14210 728 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 CD1CP29017 333 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 AKT1P31749 480 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 STIP1P31948 543 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 ACTN2P35609 894 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 ITGA9Q13797 1035 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 POU6F1Q14863 301 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 TBC1D25Q3MII6 688 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 PHF19Q5T6S3 580 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 GLIS1Q8NBF1 620 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 NUDT22Q9BRQ3 303 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 SEMA6CQ9H3T2 930 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRN2-204ENST00000404321 FAM96AQ9H5X1 160 aa17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms