RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 VWA7Q9Y334 891 aa6□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF711Q9Y462 761 aa6□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 MIA3Q5JRA6 1907 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 DOCK6Q96HP0 2047 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 CAPN8A6NHC0 703 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 EPOPA6NHQ4 379 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 AGAP14A8MT82 685 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 CCL22O00626 93 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF195O14628 629 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 STX7O15400 261 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM13O60858 407 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 DKK1O94907 266 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 FSBPO95073 299 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 POP4O95707 220 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ASLP04424 464 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 CYP17A1P05093 508 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 PIRTP0C851 137 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 RALBP11234 206 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 FCARP24071 287 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ARRB2P32121 409 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ADMP35318 185 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 NRIP1P48552 1158 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 NUMBP49757 651 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 STK19P49842 368 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 CDKN2DP55273 166 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 DNAJB13P59910 316 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 TMPRSS15P98073 1019 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ECT2LQ008S8 904 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 PFKPQ01813 784 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 BCL2L1Q07817 233 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 BNIP1Q12981 228 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 CARD16Q5EG05 197 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 TECRLQ5HYJ1 363 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 FAM78AQ5JUQ0 283 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM207Q6UWW9 146 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ATG14Q6ZNE5 492 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC121Q6ZUS5 278 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ZSWIM9Q86XI8 627 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 CAMK1DQ8IU85 385 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 PIANPQ8IYJ0 282 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 AHI1Q8N157 1196 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 FITM2Q8N6M3 262 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 EFHBQ8N7U6 833 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 KDM1BQ8NB78 822 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 OR6P1Q8NGX9 317 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 RFWD2Q8NHY2 731 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 DTX3LQ8TDB6 740 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 HCAR2Q8TDS4 363 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 KCTD4Q8WVF5 259 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 SMARCD2Q92925 531 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 NXNL1Q96CM4 212 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ELMO2Q96JJ3 720 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ASB16Q96NS5 453 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 BIRC8Q96P09 236 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 TM6SF2Q9BZW4 377 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 MYLK2Q9H1R3 596 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ABCF3Q9NUQ8 709 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 GDE1Q9NZC3 331 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 SLC25A13Q9UJS0 675 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ERVW-1Q9UQF0 538 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 WNT6Q9Y6F9 365 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 COMMD10Q9Y6G5 202 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa5.99□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 GBF1Q92538 1859 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 MYO7AQ13402 2215 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 MEGF11A6BM72 1044 aa5.98□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 BUD23O43709 281 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms