RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 CIDEAO60543 219 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 LDLRP01130 860 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 INHBAP08476 426 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRT19P08727 400 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP1A3P13637 1013 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ALDH4A1P30038 563 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 PBX3P40426 434 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 NAB2Q15742 525 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM30BQ3MIR4 351 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF876PQ49A33 203 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 C14orf177Q52M58 125 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ASPRV1Q53RT3 343 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF805Q5CZA5 627 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 WDR38Q5JTN6 314 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMC5Q8IY18 1101 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 EMC1Q8N766 993 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM116Q8NCL8 245 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF248Q8NDW4 579 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ETNPPLQ8TBG4 499 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 TAS1R2Q8TE23 839 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 PIGMQ9H3S5 423 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRPC7Q9HCX4 862 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIF26BQ2KJY2 2108 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 WDR81Q562E7 1941 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANKRD66B4E2M5 251 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM178BH3BS89 294 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 BAG4O95429 457 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNF224P0DH78 156 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 CSF2RAP15509 400 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHRNB4P30926 498 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 DCTP40126 519 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 PIK3CAP42336 1068 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 VEGFCP49767 419 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCR9P51686 369 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 DRG2P55039 364 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD81P60033 236 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZBED6P86452 979 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 PMP22Q01453 160 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 RUNX1T1Q06455 604 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRIF1Q5T3J3 769 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYP20A1Q6UW02 462 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 CPLX4Q7Z7G2 160 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 GBGT1Q8N5D6 347 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC5A8Q8N695 610 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 FRMD1Q8N878 549 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR8K5Q8NH50 307 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPP4R1Q8TF05 950 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ABHD8Q96I13 439 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 NEUROD6Q96NK8 337 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 WDFY2Q96P53 400 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 LITAFQ99732 161 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 FSD1Q9BTV5 496 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM39BQ9GZU3 492 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 IRAK4Q9NWZ3 460 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 KLHL9Q9P2J3 617 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLIC4Q9Y696 253 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCNE2Q9Y6J6 123 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A0G2JLW4 131 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1W2PP11 408 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 KANSL1LA0AUZ9 987 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANTXRLA6NF34 631 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 DUXAA6NLW8 204 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 BUD23O43709 281 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 NDUFS3O75489 264 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 BMP10O95393 424 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 NR3C1P04150 777 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ICAM1P05362 532 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 TFAP2AP05549 437 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 MBTD1Q05BQ5 628 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADIPOQQ15848 244 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 TECRLQ5HYJ1 363 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 LCN10Q6JVE6 187 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLXDC2Q6UX71 529 aa2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms