RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 RPL21P46778 160 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MAZP56270 477 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 IL1RL1Q01638 556 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RGS1Q08116 209 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ACAP2Q15057 778 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 DEFB109BQ30KR1 87 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF470Q6ECI4 717 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 WDR5BQ86VZ2 330 aa4.4□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 OR52K1Q8NGK4 314 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RAD51AP1Q96B01 352 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MS4A14Q96JA4 679 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CAMK1GQ96NX5 476 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MAP3K3Q99759 626 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF670Q9BS34 389 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ULBP3Q9BZM4 244 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 TBK1Q9UHD2 729 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PADI1Q9ULC6 663 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 WASF2Q9Y6W5 498 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TRIP11Q15643 1979 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SCN1AP35498 2009 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC151A5D8V7 595 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SDR42E2A6NKP2 422 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 IQCF5A8MTL0 148 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 A8MUA0 341 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 BTNL10A8MVZ5 291 aa4.4□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC28A2O43868 658 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 LRCH4O75427 683 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 OR2B3O76000 313 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 KCNK5O95279 499 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CPNE6O95741 557 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 NUDT14O95848 222 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 AGTP01019 485 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 NTRK1P04629 796 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ACY1Q03154 408 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 STX4Q12846 297 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 HIF1AQ16665 826 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CA9Q16790 459 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS36Q5K4E3 855 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 LDLRAP1Q5SW96 308 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 HECTD2Q5U5R9 776 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PM20D1Q6GTS8 502 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 NEPROQ6NW34 567 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 MSANTD2Q6P1R3 559 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 COG1Q8WTW3 980 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP4.4□□□□□ -1.715e-7■■□□□ 12.4
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PTPRC-201ENST00000348564 NTAN1Q96AB6 310 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 MAGED4Q96JG8 741 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TLR10Q9BXR5 811 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CEP44Q9C0F1 390 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 OSER1Q9NX31 292 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TAS2R13Q9NYV9 303 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CLEC4EQ9ULY5 219 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 NFU1Q9UMS0 254 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SPG11Q96JI7 2443 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 OR6C74A6NCV1 312 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 H3BMM5 538 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 KRT37O76014 449 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 KRT38O76015 456 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 AGFG2O95081 481 aa4.4□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 PTPN7P35236 360 aa4.4□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 POLD2P49005 469 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CYP4F2P78329 520 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 POU4F1Q01851 419 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 BTKQ06187 659 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 HYAL2Q12891 473 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ERV3-1Q14264 604 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CNGA3Q16281 694 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 FAM214AQ32MH5 1076 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CERCAMQ5T4B2 595 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PMS2CLQ68D20 193 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 NEK5Q6P3R8 708 aa4.4□□□□□ -1.71
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