RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 TCAIMQ8N3R3 496 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 UBR7Q8N806 425 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 CNPPD1Q9BV87 410 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF446Q9NWS9 450 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 RHOQP17081 205 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 CDH3P22223 829 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB6Q15916 424 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 DPEP2Q9H4A9 486 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 ARL8BQ9NVJ2 186 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 GNPDA1P46926 289 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 CAMK1Q14012 370 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 GRB14Q14449 540 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 NECTIN3Q9NQS3 549 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 IKZF2Q9UKS7 526 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 C5orf60A6NFR6 353 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 FOXO6A8MYZ6 492 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 MAGEB3O15480 346 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 ITGA3P26006 1051 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 CTSKP43235 329 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 OLFML2AQ68BL7 652 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 MCEMP1Q8IX19 187 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 RASSF1Q9NS23 344 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 C9JVG2 144 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 GPR25O00155 361 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 OR1F1O43749 312 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 ACRP10323 421 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PPIBP23284 216 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 IPPKQ9H8X2 491 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 NRP2O60462 931 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 NDST3O95803 873 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 MMP8P22894 467 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 SEMG2Q02383 582 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PCDH1Q08174 1060 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 SFRP1Q8N474 314 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PLD5Q8N7P1 536 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 RTKNQ9BST9 563 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 STX16O14662 325 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 CLDN9O95484 217 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PRNPP04156 253 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 MON1BQ7L1V2 547 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 STYXQ8WUJ0 223 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 LRIG2O94898 1065 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 CRHR1P34998 444 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 NDUFA9Q16795 377 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 MSANTD2Q6P1R3 559 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 GPER1Q99527 375 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 CMPK1P30085 196 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 MASP1P48740 699 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 CDH4P55283 916 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 GTF2H2Q13888 395 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 TAC4Q86UU9 113 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 TAF4O00268 1085 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 GOT2P00505 430 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 VPS26BQ4G0F5 336 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 LPCAT4Q643R3 524 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 RTL4Q6ZR62 310 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 MREGQ8N565 214 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 OR52J3Q8NH60 311 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 CPQQ9Y646 472 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 AP4B1Q9Y6B7 739 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 GSTT1P30711 240 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 RPIAP49247 311 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PRSS58Q8IYP2 241 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 RHPN2P1A8MT19 583 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 C9IYK1 514 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 DRG2P55039 364 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 GJA9P57773 515 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 GNA12Q03113 381 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 HSPB3Q12988 150 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF460Q14592 562 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 GCNT6Q5T4J0 391 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 ATG14Q6ZNE5 492 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 MAML3Q96JK9 1138 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 GAL3ST4Q96RP7 486 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 FAM192AQ9GZU8 254 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PLLPQ9Y342 182 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 TPSB2P20231 275 aa22.21■■□□□ 1.15
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