RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322054.9

EHD3-201, Transcript of EH domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EHD3, Length 4,636 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3-201ENST00000322054 UBR2Q8IWV8 1755 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 FGF19O95750 216 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 CLTBP09497 229 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 GJA1P17302 382 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 PTPN2P17706 415 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 RPL3P39023 403 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 KIR3DL1P43629 444 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 LRRC73Q5JTD7 316 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 FAM156AQ8NDB6 213 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 KLHL32Q96NJ5 620 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 ADAMTS10Q9H324 1103 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 NDOR1Q9UHB4 597 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 SCML2Q9UQR0 700 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 CHD4Q14839 1912 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 ITM2AO43736 263 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 ATG13O75143 517 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 NIPSNAP2O75323 286 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 BEST1O76090 585 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 PRKCGP05129 697 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 EPHX1P07099 455 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 SLC20A2Q08357 652 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 ZNF280BQ86YH2 543 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 KIAA2013Q8IYS2 634 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 SEC14L1Q92503 715 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 FAIM2Q9BWQ8 316 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 CERS4Q9HA82 394 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 CNTN5O94779 1100 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 SOX6P35712 828 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 CSKP41240 450 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 GLYATQ6IB77 296 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 SPPL2CQ8IUH8 684 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 SLC28A3Q9HAS3 691 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 RHBDL2Q9NX52 303 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 A0A088AWK7 358 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 ENPP3O14638 875 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 PRKCHP24723 683 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 ZNF605Q86T29 641 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 SERINC5Q86VE9 423 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 TMEM130Q8N3G9 435 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 USP7Q93009 1102 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 ACDQ96AP0 544 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 HEPHQ9BQS7 1158 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 HERPUD2Q9BSE4 406 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 SGK2Q9HBY8 427 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 ARHGEF3Q9NR81 526 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 TBC1D3EA0A087X179 549 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 ILVBLA1L0T0 632 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 TBC1D3LB9A6J9 549 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 CLDN9O95484 217 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 NFATC1O95644 943 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 TBC1D3HP0C7X1 549 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 UROSP10746 265 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 UGT1A6P19224 532 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 UGT1A1P22309 533 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 UGT1A4P22310 534 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 UGT1A3P35503 534 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 UGT1A5P35504 534 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 PAOXQ6QHF9 649 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 C17orf64Q86WR6 236 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 OFCC1Q8IZS5 231 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 OSBPL11Q9BXB4 747 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 UNC93B1Q9H1C4 597 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 ARMC7Q9H6L4 198 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 USP29Q9HBJ7 922 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 PSAT1Q9Y617 370 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 U3KQV3 271 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 MGRN1O60291 552 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 MT-ND1P03886 318 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 HTR1BP28222 390 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 NOS3P29474 1203 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 RPL5P46777 297 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 SLC18A2Q05940 514 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 C16orf72Q14CZ0 275 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 SIRPB2Q5JXA9 342 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 FAM124AQ86V42 546 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 SFRP1Q8N474 314 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 UBR7Q8N806 425 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD3-201ENST00000322054 MIEF2Q96C03 454 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms