RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304954.3

CSN3-201, Transcript of casein kappa, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSN3, Length 836 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3-201ENST00000304954 GCSAMQ8N6F7 178 aa4.7□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 SECTM1Q8WVN6 248 aa4.7□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 CALML4Q96GE6 196 aa4.7□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 SEMA3CQ99985 751 aa4.7□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 PIGMQ9H3S5 423 aa4.7□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 SETD4Q9NVD3 440 aa4.7□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 A0A1W2PS18 150 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 TPPPO94811 219 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 GH2P01242 217 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 HADHAP40939 763 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 MLLT10P55197 1068 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 NLRP5P59047 1200 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 PLIN5Q00G26 463 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 CDC16Q13042 620 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 GAGE2BQ13066 116 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 GAGE5Q13069 117 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 GAGE6Q13070 117 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 KCNC3Q14003 757 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 MVPQ14764 893 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 GAGE2EQ4V326 116 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 CFAP161Q6P656 301 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 SZRD1Q7Z422 152 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 PM20D2Q8IYS1 436 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 C1orf87Q8N0U7 546 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 SLC38A9Q8NBW4 561 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 OR2AK2Q8NG84 335 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 EGLN2Q96KS0 407 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 CTAGE1Q96RT6 745 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 SYT17Q9BSW7 474 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 SPRY4Q9C004 299 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 EVA1AQ9H8M9 152 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 ZNF580Q9UK33 172 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa4.69□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 A0A1B0GUV1 79 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 AGAP14A8MT82 685 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 H3BQ06 376 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 ZNHIT1O43257 154 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 MITFO75030 526 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 WDR1O75083 606 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 FAM106CPP0CH98 169 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 PLA2G2AP14555 144 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 GARSP41250 739 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 PDLIM4P50479 330 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 ARSEP51690 589 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 MFAP4P55083 255 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 GTF2H2Q13888 395 aa4.68□□□□□ -1.66
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CSN3-201ENST00000304954 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 ZNF280DQ6N043 979 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 MAP7D3Q8IWC1 876 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 ZNF34Q8IZ26 560 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 RFLNBQ8N5W9 214 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 SPATA22Q8NHS9 363 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 TMEM255BQ8WV15 326 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 NEUROD6Q96NK8 337 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 LRRC1Q9BTT6 524 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 HRH4Q9H3N8 390 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 RETREG1Q9H6L5 497 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 SWAP70Q9UH65 585 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 POLG2Q9UHN1 485 aa4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa4.67□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 ASPDHA6ND91 283 aa4.67□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 PRSS44E7EML9 344 aa4.67□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 DDNO94850 711 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 SLC15A1P46059 708 aa4.67□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 LMAN1P49257 510 aa4.67□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 AMPHP49418 695 aa4.67□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 MMP14P50281 582 aa4.67□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 CLDN20P56880 219 aa4.67□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 SLC20A2Q08357 652 aa4.67□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 ZBTB17Q13105 803 aa4.67□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 NTRK2Q16620 822 aa4.67□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 ASPRV1Q53RT3 343 aa4.67□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa4.67□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.67□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CSN3-201ENST00000304954 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
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