RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 ACBD6Q9BR61 282 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 TCEA3O75764 348 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CCNDBP1O95273 360 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 BICRALQ6AI39 1079 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CYP4X1Q8N118 509 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 OR6K2Q8NGY2 324 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ATG13O75143 517 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 IDH3AP50213 366 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 DSC2Q02487 901 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CBR4Q8N4T8 237 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SCAIQ8N9R8 606 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEH1Q9H213 219 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 IRAK3Q9Y616 596 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 TULP2O00295 520 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 FADS2O95864 444 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 FABP3P05413 133 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 UGT1A5P35504 534 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 MBTD1Q05BQ5 628 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ELP6Q0PNE2 266 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM199Q8N511 208 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ING3Q9NXR8 418 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 H3BM21 787 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PSMD11O00231 422 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 NDST2P52849 883 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC6AQ6EIG7 209 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 GULP1Q9UBP9 304 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SEC14L3Q9UDX4 400 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 FAM86C2PA6NEL3 165 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A12O75746 678 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CCR3P51677 355 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF248Q8NDW4 579 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SLC7A4O43246 635 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CCL23P55773 120 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 FPGTO14772 594 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CASKO14936 926 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 FGF19O95750 216 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 UBR7Q8N806 425 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ADH1CP00326 375 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SP3Q02447 781 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PCDH19Q8TAB3 1148 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ACAT2Q9BWD1 397 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 IGFLR1Q9H665 355 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PER2O15055 1255 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ANGPTL1O95841 491 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 GNA12Q03113 381 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 HKDC1Q2TB90 917 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF554Q86TJ5 538 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 NIPA2Q8N8Q9 360 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 OGNP20774 298 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 OMPP47874 163 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PARP8Q8N3A8 854 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf65Q8NCR3 313 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF222Q9UK12 451 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 KELP23276 732 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 AQP1P29972 269 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CTNNB1P35222 781 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CDH4P55283 916 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 TMPRSS11BQ86T26 416 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 NAT14Q8WUY8 206 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 AP2M1Q96CW1 435 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 MCMBPQ9BTE3 642 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 RASSF1Q9NS23 344 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 MAT2BQ9NZL9 334 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP97Q9P2B7 532 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 NMBRP28336 390 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 RPIAP49247 311 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 GLUD2P49448 558 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 GCNT6Q5T4J0 391 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A24Q6NUK1 477 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SNX27Q96L92 541 aa20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms