RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 DEC1Q9P2X7 70 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 SNNO75324 88 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 BPGMP07738 259 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 TPH1P17752 444 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 CDK18Q07002 472 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 SLC14A2Q15849 920 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 MAP7D1Q3KQU3 841 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 CERCAMQ5T4B2 595 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 PHTF2Q8N3S3 785 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 TSPAN14Q8NG11 270 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 COX4I2Q96KJ9 171 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 CIPCQ9C0C6 399 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD36A6QL64 1941 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 MATN2O00339 956 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 TUBB3Q13509 450 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 C22orf39Q6P5X5 142 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 HLA-CQ95604 372 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 NXPE3Q969Y0 559 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 MRGPRX3Q96LB0 322 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 BIRC8Q96P09 236 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 TMED5Q9Y3A6 229 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 PRRT4C9JH25 899 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 CES1P23141 567 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 TGFBIQ15582 683 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 AAK1Q2M2I8 961 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 NCEH1Q6PIU2 408 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 SFTPA1Q8IWL2 248 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 OR6K2Q8NGY2 324 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 HAUS8Q9BT25 410 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 BRD9Q9H8M2 597 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 COQ6Q9Y2Z9 468 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 CASC4Q6P4E1 433 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 FRMD7Q6ZUT3 714 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 GSDMBQ8TAX9 411 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 FEM1CQ96JP0 617 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 BFARQ9NZS9 450 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 CRHR1P34998 444 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 ACADVLP49748 655 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 PTPRNQ16849 979 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 C16orf46Q6P387 395 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 TRIB3Q96RU7 358 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 FUOMA2VDF0 154 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 STAMBPO95630 424 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF23P17027 643 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 CLCN2P51788 898 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 DLG2Q15700 870 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 TERB1Q8NA31 727 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 CMTM5Q96DZ9 223 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 MYO19Q96H55 970 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 TBC1D23Q9NUY8 699 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 THAP1Q9NVV9 213 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 MKS1Q9NXB0 559 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 PADI4Q9UM07 663 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 AP3B1O00203 1094 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 ADAM23O75077 832 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 SOX9P48436 509 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 NPY2RP49146 381 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 NUP107P57740 925 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 UNC5BQ8IZJ1 945 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 OR2AP1Q8NGE2 309 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 CEP44Q9C0F1 390 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 IL22Q9GZX6 179 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 ELOVL2Q9NXB9 296 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 IGSF6O95976 241 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 AP1S1P61966 158 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 TRAF2Q12933 501 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 SPIDRQ14159 915 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 GALNT3Q14435 633 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 CATSPER1Q8NEC5 780 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF778Q96MU6 729 aa20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms