RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257552.6

MSI1-201, Transcript of musashi RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSI1, Length 2,975 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1-201ENST00000257552 IPPQ9Y573 584 aa14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 TIMM22Q9Y584 194 aa14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 MTSS1O43312 755 aa14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 DNAJB1P25685 340 aa14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 PIGAP37287 484 aa14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 ALDH3A2P51648 485 aa14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 TKTL1P51854 596 aa14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 VBP1P61758 197 aa14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 DAG1Q14118 895 aa14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 CTF1Q16619 201 aa14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 PFKFB4Q16877 469 aa14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 MFSD4BQ5TF39 518 aa14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 HECTD2Q5U5R9 776 aa14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 ADCK1Q86TW2 530 aa14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 HGH1Q9BTY7 390 aa14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 C8orf4Q9NR00 106 aa14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 OR12D3Q9UGF7 316 aa14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 CRYL1Q9Y2S2 319 aa14.66□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 C16orf96A6NNT2 1141 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 AZIN1O14977 448 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 LRIG2O94898 1065 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 LBPP18428 481 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 SCNN1AP37088 669 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 MAP3K7CLP57077 242 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 KCNK10P57789 538 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 DGCR6Q14129 220 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 ZBTB6Q15916 424 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 GLYATQ6IB77 296 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 SCML4Q8N228 414 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 NSMCE2Q96MF7 247 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 SIK2Q9H0K1 926 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 POLG2Q9UHN1 485 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 ENPP5Q9UJA9 477 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 UGT2B11O75310 529 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 ALPLP05186 524 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 UGT2B4P06133 528 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 FYNP06241 537 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 ALOX5P09917 674 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 CTGFP29279 349 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 CDKN2DP55273 166 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 KYAT1Q16773 422 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 ISCA2Q86U28 154 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 OR6P1Q8NGX9 317 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 PTERQ96BW5 349 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 CTRCQ99895 268 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 MED10Q9BTT4 135 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 SCUBE2Q9NQ36 999 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 ANKMY1Q9P2S6 941 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 AASSQ9UDR5 926 aa14.65□□□□□ -0.06
MSI1-201ENST00000257552 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 ASPDHA6ND91 283 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 XPNPEP2O43895 674 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 NDUFS2O75306 463 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 PAMP19021 973 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 CXCR3P49682 368 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 UFM1P61960 85 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 CD47Q08722 323 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 KIAA0408Q6ZU52 694 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 ABI1Q8IZP0 508 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 TTC30BQ8N4P2 665 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 NUDT8Q8WV74 236 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 RNF34Q969K3 372 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 NT5C3BQ969T7 300 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 ITCHQ96J02 903 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 ULBP1Q9BZM6 244 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 SPC25Q9HBM1 224 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 ABCB10Q9NRK6 738 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 OR51F1A6NGY5 319 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 UBXN8O00124 270 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 CRCPO75575 148 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 CAPN15O75808 1086 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 CNTN5O94779 1100 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 PRKACGP22612 351 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 MTHFRP42898 656 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 POLD2P49005 469 aa14.64□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 SEPHS1P49903 392 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.7 ms