RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.95■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 RBFAQ8N0V3 343 aa20.95■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.95■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa20.95■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 TMEM237Q96Q45 408 aa20.95■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 TMEM114B3SHH9 223 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 MTHFRP42898 656 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 CLCN7P51798 805 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 GPR33Q49SQ1 333 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 MAVSQ7Z434 540 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 FAM129BQ96TA1 746 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 DRC3Q9H069 523 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 PRO3102Q9H379 93 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 DKK3Q9UBP4 350 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 PPM1HQ9ULR3 514 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 LRRK1Q38SD2 2015 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 AGAP14A8MT82 685 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 CDC7O00311 574 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 TSPAN12O95859 305 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 MPSTP25325 297 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 WASP42768 502 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 LSMEM2Q8N112 164 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 ARRDC3Q96B67 414 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 KCNK4Q9NYG8 393 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.94■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 ECI2O75521 394 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 DCTN3O75935 186 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 IPO13O94829 963 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 PRNPP04156 253 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF30P17039 623 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 RCN2Q14257 317 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 SETDB1Q15047 1291 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 TSNQ15631 228 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 GALNTL6Q49A17 601 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 OR8D1Q8WZ84 308 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 TTC1Q99614 292 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 SPATA16Q9BXB7 569 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 DERL2Q9GZP9 239 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 PKD2L2Q9NZM6 624 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 LMCD1Q9NZU5 365 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 H3BQ06 376 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 UBXN8O00124 270 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 EPHX1P07099 455 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 MMP12P39900 470 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 PRKAA2P54646 552 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 PTPN5P54829 565 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 KDM1BQ8NB78 822 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 UCMAQ8WVF2 138 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 SUSD6Q92537 303 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 LINGO1Q96FE5 620 aa20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 TRIM16O95361 564 aa20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 B4GALNT1Q00973 533 aa20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 TLDC1Q6P9B6 456 aa20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 ATOH8Q96SQ7 321 aa20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 COMMD10Q9Y6G5 202 aa20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 BTN3A1O00481 513 aa20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 SPINT1O43278 529 aa20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 MTHFD2P13995 350 aa20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 CALRP27797 417 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 GRIA2P42262 883 aa20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 SCTRP47872 440 aa20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 DPPA4Q7L190 304 aa20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 CACUL1Q86Y37 369 aa20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 FAM161BQ96MY7 647 aa20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 FAM83DQ9H4H8 585 aa20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.92■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 PLXNA2O75051 1894 aa20.91■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF195O14628 629 aa20.91■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 MTX2O75431 263 aa20.91■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 CD9P21926 228 aa20.91■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 DNAJB13P59910 316 aa20.91■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 IL2P60568 153 aa20.91■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
RFXAP-201ENST00000255476 ZBTB16Q05516 673 aa20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms