RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 NR5A2O00482 541 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 NME4O00746 187 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 TPST1O60507 370 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 LILRB3O75022 631 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 SUPT3HO75486 399 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 ATP6AP2O75787 350 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 HLA-DQB2P05538 268 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 UGT1A6P19224 532 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 TACR2P21452 398 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 ANKDD1AQ495B1 522 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 CLEC6AQ6EIG7 209 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 TMEM150AQ86TG1 271 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 RETREG3Q86VR2 466 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 PSMG2Q969U7 264 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 SLC45A3Q96JT2 553 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 COG8Q96MW5 612 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 IL12RB2Q99665 862 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 INSL5Q9Y5Q6 135 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 LCHNA4D1U4 455 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 CLOCKO15516 846 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 SYN1P17600 705 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 OR1E1P30953 314 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 ZNF33AQ06730 810 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 BNIP2Q12982 314 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 PMS2P3Q13401 168 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 SEPT6Q14141 434 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 ATP6AP1Q15904 470 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 GPR107Q5VW38 600 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 DENND5AQ6IQ26 1287 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 FUNDC1Q8IVP5 155 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 TTC16Q8NEE8 873 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 COX4I2Q96KJ9 171 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 SLC22A12Q96S37 553 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 TRMOQ9BU70 441 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 CD320Q9NPF0 282 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 BPTFQ12830 3046 aa20.04■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 TGM5O43548 720 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 PEX11BO96011 259 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 DCKP27707 260 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 VEPH1Q14D04 833 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 NEPROQ6NW34 567 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 C19orf60Q96EN9 201 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 FEM1CQ96JP0 617 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 FCRL5Q96RD9 977 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 OLFM1Q99784 485 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 ZBP1Q9H171 429 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 GSTO2Q9H4Y5 243 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 C8orf4Q9NR00 106 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 ABCD2Q9UBJ2 740 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 NDUFAF1Q9Y375 327 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 A0A0J9YYE9 177 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 AURKAO14965 403 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 ACSL4O60488 711 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 C7P10643 843 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 GPX3P22352 226 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 PPM1AP35813 382 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 MAXP61244 160 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 RAB39AQ14964 217 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 KIAA0408Q6ZU52 694 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 TCEAL8Q8IYN2 117 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 GOLM1Q8NBJ4 401 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 TSPAN17Q96FV3 270 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 DOK1Q99704 481 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 GLOD4Q9HC38 313 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 TREX1Q9NSU2 369 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 EGFL7Q9UHF1 273 aa20.03■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa20.02■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 STC2O76061 302 aa20.02■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 TFPTP0C1Z6 253 aa20.02■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 VARSP26640 1264 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 ACVRL1P37023 503 aa20.02■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 GEMP55040 296 aa20.02■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 RPS24P62847 133 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 FPGSQ05932 587 aa20.02■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 TMTC4Q5T4D3 741 aa20.02■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 LCN8Q6JVE9 175 aa20.02■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 FBXL20Q96IG2 436 aa20.02■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 LRCH3Q96II8 777 aa20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms