RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ZNF516Q92618 1163 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 USP7Q93009 1102 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 LRRC3Q9BY71 257 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 A0A0J9YYE9 177 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 EBLN1P0CF75 366 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ORC1Q13415 861 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SEMA3AQ14563 771 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 KBTBD6Q86V97 674 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CATSPER2Q96P56 530 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ALG2Q9H553 416 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 NRP1O14786 923 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 INPP4BO15327 924 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 VEGFDO43915 354 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TRAF7Q6Q0C0 670 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 NRSN1Q8IZ57 195 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 RFKQ969G6 155 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 RMI1Q9H9A7 625 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PSMD11O00231 422 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MFSD11O43934 449 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SCELO95171 688 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SHBGP04278 402 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ZNF24P17028 368 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 KIR3DL1P43629 444 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CDC42P60953 191 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 AP5B1Q2VPB7 878 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 BROXQ5VW32 411 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 RINLQ6ZS11 566 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 IKBIPQ70UQ0 350 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CAMK1GQ96NX5 476 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PANX1Q96RD7 426 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SLC1A5Q15758 541 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MICU2Q8IYU8 434 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CXorf40BQ96DE9 158 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MARK4Q96L34 752 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SLC32A1Q9H598 525 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CLN6Q9NWW5 311 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 IL12AP29459 219 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 RAB14P61106 215 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ECT2LQ008S8 904 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 DEFB128Q7Z7B8 93 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TMEM192Q8IY95 271 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 LINGO1Q96FE5 620 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MIA3Q5JRA6 1907 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TRIM24O15164 1050 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MGRN1O60291 552 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MFN2O95140 757 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PRAMEF1O95521 474 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PRPS1L1P21108 318 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 FMO4P31512 558 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 OVGP1Q12889 678 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ZNF605Q86T29 641 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ADAM32Q8TC27 787 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MED8Q96G25 268 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 LRRC72A6NJI9 287 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 OR5K4A6NMS3 321 aa6.28□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SLC10A3P09131 477 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms