RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nup93Q8BJ71 819 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcns3Q8BQZ8 491 aa20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slco6d1Q9D5W6 683 aa20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vps35Q9EQH3 796 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smpd3Q9JJY3 655 aa20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Asb4Q9WV71 426 aa20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gnat1P20612 350 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ErgP81270 486 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arf5P84084 180 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam160a1Q505K2 1081 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf145Q5SWK7 663 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr19Q61121 415 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kyat1Q8BTY1 424 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tspan14Q8QZY6 270 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rrp15Q9CYX7 281 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ndufaf4Q9D1H6 173 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Phf10Q9D8M7 497 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q9D937 123 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GatmQ9D964 423 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P33monoxQ9DBN4 303 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MecrQ9DCS3 373 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ScelQ9EQG3 652 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NfkbizQ9EST8 728 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nipa2Q9JJC8 359 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trip4Q9QXN3 581 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 St6galnac1Q9QZ39 526 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sec22bO08547 215 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Grpel2O88396 224 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Agtr2P35374 363 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adrbk2Q3UYH7 688 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arnt2Q61324 712 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HltfQ6PCN7 1003 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DdnQ80TS7 710 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MtbpQ8BJS8 894 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mettl3Q8C3P7 580 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CntrobQ8CB62 887 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r18Q8R2C8 299 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plpp3Q99JY8 312 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mrpl17Q9D8P4 176 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dbn1Q9QXS6 706 aa20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arhgap36B1AUC7 590 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 9230113P08RikD3YWX3 137 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Alox8O35936 677 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HmgclP38060 325 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BtrcQ3ULA2 605 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc22a15Q504N2 544 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem121Q80XA0 318 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cxcr1Q810W6 351 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abi3Q8BYZ1 367 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmc7Q8C428 726 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Glcci1Q8K3I9 537 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SmtnQ921U8 923 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DhddsQ99KU1 333 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tex19.1Q99MV2 351 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rsph14Q9D3W1 341 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tor1bQ9ER41 336 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Epb41l4bQ9JMC8 527 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Umodl1Q5DID3 1319 aa20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r85G3UW56 850 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Alkal1J3QPP8 127 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pfdn6Q03958 127 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbm44Q3V089 1013 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Actr5Q80US4 605 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HadhaQ8BMS1 763 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Grsf1Q8C5Q4 479 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TbcelQ8C5W3 424 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lgals2Q9CQW5 130 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 L3hypdhQ9CXA2 354 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nudt14Q9D142 222 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam162aQ9D6U8 155 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Scnn1bQ9WU38 638 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyb561d2Q9WUE3 222 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp2g1Q9WV19 494 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Carm1Q9WVG6 608 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm20431E9PY39 371 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gp1baO35930 734 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GhrP16882 650 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 WarsP32921 481 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hcrtr1P58307 416 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 IdsQ08890 552 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdkl4Q3TZA2 342 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CamkvQ3UHL1 512 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ceacam5Q3UKK2 947 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Esrp1Q3US41 680 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr792Q7TRH9 311 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sema3dQ8BH34 777 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prr11Q8BHE0 368 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nkiras1Q8CEC5 192 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cfap61Q8CEL2 1252 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem161aQ8VCA6 480 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Acsf2Q8VCW8 615 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr846Q8VET8 312 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmco1Q921L3 188 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AasdhpptQ9CQF6 309 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Snrnp48Q9D361 337 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tchhl1Q9D3P1 638 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Upf1Q9EPU0 1124 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il22bQ9JJY8 179 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fhl5Q9WTX7 284 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stx7O70439 261 aa20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.8 ms