RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc40a1Q9JHI9 570 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnfsf14Q9QYH9 239 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 QkiQ9QYS9 341 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sema4gQ9WUH7 837 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Apc2Q9Z1K7 2274 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igkv6-32A0A140T8N9 115 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mptx2D3YYJ7 219 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serpina3iD3Z450 408 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp4f40G3UW81 524 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r39G3UWE6 305 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fkbp8O35465 402 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pja1O55176 578 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GmnnO88513 206 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp1a1P00184 524 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adh1P00329 375 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rplp0P14869 317 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atf2P16951 487 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PdgfraP26618 1089 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dynlt1P51807 113 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kpna2P52293 529 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CrtamQ149L7 389 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mcm9Q2KHI9 1134 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm1604bQ3TRG0 118 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nxf2Q4ZGD8 691 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc42Q5SV66 316 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vav2Q60992 868 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Inpp4bQ6P1Y8 924 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r43Q80Z08 845 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rxfp3Q8BGE9 472 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mterf2Q8BKY8 385 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc184Q8BMK5 191 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cfap61Q8CEL2 1252 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Snx11Q91WL6 271 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcdhga9Q91XX9 932 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nudt21Q9CQF3 227 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Krt20Q9D312 431 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc94Q9D6J3 314 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nsmce1Q9D720 266 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Xab2Q9DCD2 855 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wnt16Q9QYS1 364 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eif3iQ9QZD9 325 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SqorQ9R112 450 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fut8Q9WTS2 575 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cpne6Q9Z140 557 aa11.06□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm884A2A9H6 3643 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tln1P26039 2541 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IqccA2ADZ8 418 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MipepA6H611 711 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trabd2bB1ATG9 517 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adgrf2E9Q4J9 644 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r75G5E8Z7 853 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pex5O09012 639 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc6a2O55192 617 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fpr-rs3O88537 343 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd2P08920 344 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gstm1P10649 218 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HmbsP22907 361 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tead1P30051 426 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab20P35295 233 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GsrP47791 500 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cops2P61202 443 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nucb2P81117 420 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ano9P86044 747 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AdmP97297 184 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fmo3P97501 534 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp560Q3URI6 754 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lamb3Q61087 1168 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PapolaQ61183 739 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ctnna2Q61301 953 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hsd3b5Q61694 373 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam149b1Q6NSV7 578 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gbp9Q8BTS3 619 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stbd1Q8C7E7 338 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lsm14bQ8CGC4 385 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fnbp1lQ8K012 605 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Unc5aQ8K1S4 898 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atg10Q8R1P4 215 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Impg1Q8R1W8 798 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 McmbpQ8R3C0 642 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nae1Q8VBW6 534 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rbmxl1Q91VM5 388 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Themis2Q91YX0 663 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trem2Q99NH8 227 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arl2Q9D0J4 184 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Desi2Q9D291 194 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rdh11Q9QYF1 316 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Magel2Q9QZ04 1284 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 UxtQ9WTZ0 157 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lbx2Q9WUN8 195 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tle6Q9WVB3 581 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Helz2E9QAM5 2947 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Awat1A2ADU9 328 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp780bE9Q2S6 806 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm8257E9Q8R3 264 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnmt3aO88508 908 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Best1O88870 551 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01679 107 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PdgfrbP05622 1098 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tyrp1P07147 537 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.2 ms