RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640511.1

SPIN3-241, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 3,102 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-241ENST00000640511 FAM45BPQ6NSW5 357 aa11.71□□□□□ -0.53
SPIN3-241ENST00000640511 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa11.71□□□□□ -0.53
SPIN3-241ENST00000640511 XXYLT1Q8NBI6 393 aa11.71□□□□□ -0.53
SPIN3-241ENST00000640511 FAM45AQ8TCE6 357 aa11.71□□□□□ -0.53
SPIN3-241ENST00000640511 STON2Q8WXE9 905 aa11.71□□□□□ -0.53
SPIN3-241ENST00000640511 ST8SIA4Q92187 359 aa11.71□□□□□ -0.53
SPIN3-241ENST00000640511 RIT1Q92963 219 aa11.71□□□□□ -0.53
SPIN3-241ENST00000640511 PHF21AQ96BD5 680 aa11.71□□□□□ -0.53
SPIN3-241ENST00000640511 TNIP3Q96KP6 325 aa11.71□□□□□ -0.53
SPIN3-241ENST00000640511 UBXN10Q96LJ8 280 aa11.71□□□□□ -0.53
SPIN3-241ENST00000640511 NEDD4LQ96PU5 975 aa11.71□□□□□ -0.53
SPIN3-241ENST00000640511 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
SPIN3-241ENST00000640511 FTHL17Q9BXU8 183 aa11.71□□□□□ -0.53
SPIN3-241ENST00000640511 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa11.71□□□□□ -0.53
SPIN3-241ENST00000640511 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa11.71□□□□□ -0.53
SPIN3-241ENST00000640511 HRH3Q9Y5N1 445 aa11.71□□□□□ -0.53
SPIN3-241ENST00000640511 ACTL7AQ9Y615 435 aa11.71□□□□□ -0.53
SPIN3-241ENST00000640511 E2F8A0AVK6 867 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 TMEM191CA6NGB0 347 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 APOL1O14791 398 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 TBC1D4O60343 1298 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 FAM86B2P0C5J1 330 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 THRBP10828 461 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 SELLP14151 372 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF3P17036 446 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 PSMB9P28065 219 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 SOX11P35716 441 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 BAMBIQ13145 260 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 AGKQ53H12 422 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 SPANXN2Q5MJ10 180 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 TBPL2Q6SJ96 375 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 C1orf186Q6ZWK4 172 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 FAM124AQ86V42 546 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 CLEC4FQ8N1N0 589 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 WDR48Q8TAF3 677 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 TEX47Q8TBZ9 253 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 ASB12Q8WXK4 309 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 KLHL6Q8WZ60 621 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 FOXJ1Q92949 421 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 FOPNLQ96NB1 174 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 STRA6Q9BX79 667 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 TMEM39AQ9NV64 488 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 COPS3Q9UNS2 423 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 GJA3Q9Y6H8 435 aa11.71□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 ARAP2Q8WZ64 1704 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 F8W036 122 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 TFECO14948 347 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 STX7O15400 261 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 HDCP19113 662 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 F8A1P23610 371 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 CYP3A7P24462 503 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 ALDH3A2P51648 485 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 ARSFP54793 590 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 ROR1Q01973 937 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 LCN8Q6JVE9 175 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 AMER2Q8N7J2 671 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 OR8H1Q8NGG4 311 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 FRS2Q8WU20 508 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 ELMO3Q96BJ8 720 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 SDHAF3Q9NRP4 125 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 PAK5Q9P286 719 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF639Q9UID6 485 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 TINAGQ9UJW2 476 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 GGA1Q9UJY5 639 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 G3V2L1 256 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 NRP2O60462 931 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 GREM1O60565 184 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 APOC2P02655 101 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 MAOBP27338 520 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 TGFBR1P36897 503 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 HNF4AP41235 474 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 CYP4F2P78329 520 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 CYP4F3Q08477 520 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF124Q15973 351 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 RETSATQ6NUM9 610 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 TXNDC11Q6PKC3 985 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 TCTE3Q8IZS6 198 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 ANKRD52Q8NB46 1076 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 FBXL13Q8NEE6 735 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 SIPA1Q96FS4 1042 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 CBWD1Q9BRT8 395 aa11.7□□□□□ -0.54
SPIN3-241ENST00000640511 TTPALQ9BTX7 342 aa11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms