RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635865.1

ATRX-220, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-220ENST00000635865 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 TM9SF3Q9HD45 589 aa2.51□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 Q9N2J8 555 aa2.51□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 NGBQ9NPG2 151 aa2.51□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 FAM118AQ9NWS6 357 aa2.51□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 SOHLH2Q9NX45 425 aa2.51□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 AIPL1Q9NZN9 384 aa2.51□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 NTMQ9P121 344 aa2.51□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 ANKMY1Q9P2S6 941 aa2.51□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 KCNN3Q9UGI6 736 aa2.51□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 MAD2L2Q9UI95 211 aa2.51□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 FZD4Q9ULV1 537 aa2.51□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 SH2B3Q9UQQ2 575 aa2.51□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 TMED5Q9Y3A6 229 aa2.51□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 NOX1Q9Y5S8 564 aa2.51□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa2.51□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 ZNF541Q9H0D2 1346 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 TRGV11A0A075B6L2 103 aa2.5□□□□□ -2.01
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ATRX-220ENST00000635865 A0A1B0GWJ7 208 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 C1orf226A1L170 272 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 ELOVL7A1L3X0 281 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 CBY3A6NI87 242 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 FAM157AC9JC47 383 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 LEFTY2O00292 366 aa2.5□□□□□ -2.01
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ATRX-220ENST00000635865 TEX28O15482 410 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 CLDN3O15551 220 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 B4GALT4O60513 344 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 CDC14BO60729 498 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 PRAMEF11O60813 436 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 RAD51DO75771 328 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 KIAA0754O94854 1291 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 OR6B1O95007 311 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 MBPP02686 304 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 SERPING1P05155 500 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 RHOP08100 348 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 ADH4P08319 380 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 C1QTNF9P0C862 333 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 EBLN1P0CF75 366 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 G6PDP11413 515 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 PPP3CBP16298 524 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 CR2P20023 1033 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 EDN2P20800 178 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 NR2F2P24468 414 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 DNAJB1P25685 340 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 YWHAQP27348 245 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 NDUFS1P28331 727 aa2.5□□□□□ -2.01
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ATRX-220ENST00000635865 GDI1P31150 447 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 SHMT1P34896 483 aa2.5□□□□□ -2.01
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ATRX-220ENST00000635865 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 VPS41P49754 854 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 DIO1P49895 249 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 CYP2J2P51589 502 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 NXPH1P58417 271 aa2.5□□□□□ -2.01
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ATRX-220ENST00000635865 CFHR3Q02985 330 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 RUNX1T1Q06455 604 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 ITGADQ13349 1161 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 GAB1Q13480 694 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 LPIN1Q14693 890 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 KARSQ15046 597 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 MAPK11Q15759 364 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 CYP1B1Q16678 543 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 CYP2A13Q16696 494 aa2.5□□□□□ -2.01
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ATRX-220ENST00000635865 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 PLK5Q496M5 336 aa2.5□□□□□ -2.01
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ATRX-220ENST00000635865 IFI44LQ53G44 452 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 RABL3Q5HYI8 236 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 ZNF618Q5T7W0 954 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 RAET1GQ6H3X3 334 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 CENPPQ6IPU0 288 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 ANKRD16Q6P6B7 361 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 FAM198BQ6UWH4 519 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 LCTLQ6UWM7 567 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 NHLRC1Q6VVB1 395 aa2.5□□□□□ -2.01
ATRX-220ENST00000635865 SLC36A4Q6YBV0 504 aa2.5□□□□□ -2.01
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