RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 GPAMQ9HCL2 828 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 MAN2B1O00754 1011 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 WNT9AO14904 365 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 AP1G1O43747 822 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 PLIN3O60664 434 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 C7P10643 843 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 CD9P21926 228 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.548e-7■■■■□ 23
CAPNS1-215ENST00000628018 CREB5Q02930 508 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 ITIH4Q14624 930 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 CACUL1Q86Y37 369 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 ADHFE1Q8IWW8 467 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAM1L1Q8N609 369 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 KCTD4Q8WVF5 259 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 DTD2Q96FN9 168 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA16Q9BXB7 569 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCG8Q9H221 673 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 SMOXQ9NWM0 555 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRK1Q38SD2 2015 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 NEMP1O14524 444 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL2O95198 593 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 PROCP04070 461 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINB4P48594 390 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 TAS2R38P59533 333 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 DLG1Q12959 904 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC153Q494R4 210 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 PIM3Q86V86 326 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 HDDC3Q8N4P3 179 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 UBXN10Q96LJ8 280 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 BOCQ9BWV1 1114 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJC6O75061 913 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 RHOBTB1O94844 696 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 C6P13671 934 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC26A3P40879 764 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC15Q0P6D6 951 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 PDK4Q16654 411 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM207Q6UWW9 146 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 TMPRSS6Q8IU80 811 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM131CQ96AQ9 280 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 TSNARE1Q96NA8 513 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR78Q96P69 363 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 CLPBQ9H078 707 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 EPN3Q9H201 632 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 TAS2R13Q9NYV9 303 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 SERGEFQ9UGK8 458 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PP55 124 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 GMNCA6NCL1 334 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 MMP20O60882 483 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 SEC24CP53992 1094 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 ZP2Q05996 745 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF284Q2VY69 593 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 EOGTQ5NDL2 527 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF852Q6ZMS4 543 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF765Q7L2R6 523 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 CXorf40AQ8TE69 158 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNJ9Q92806 393 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 NXNL1Q96CM4 212 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 NMRAL1Q9HBL8 299 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 IGSF5Q9NSI5 407 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 COQ6Q9Y2Z9 468 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR91A4D1P6 747 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPAN6O43657 245 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 NIPSNAP2O75323 286 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 DNTTP04053 509 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 RGS9BPQ6ZS82 235 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 SPNS2Q8IVW8 549 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD49Q8WVL7 239 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 AP2M1Q96CW1 435 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 COPS8Q99627 209 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 MMP17Q9ULZ9 603 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 SORCS3Q9UPU3 1222 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS21Q9Y6M0 314 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 FADS2P1A8MWK0 482 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS26AO75436 327 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC166P0CW27 439 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 TAC1P20366 129 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 NSG1P42857 185 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 IRX4P78413 519 aa24.66■■□□□ 1.54
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