RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 ESRRBO95718 433 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 MLYCDO95822 493 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRLP01236 227 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 F11P03951 625 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CYBBP04839 570 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC10A3P09131 477 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 LINC00032P0C843 101 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 SPATA31D3P0C874 917 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CKBP12277 381 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 PKMP14618 531 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
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IGHV3-54-201ENST00000622166 LPOP22079 712 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 FASP25445 335 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 FMO4P31512 558 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC6A4P31645 630 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 GSK3BP49841 420 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CDK9P50750 372 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CLCN4P51793 760 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 OXCT1P55809 520 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRIM32Q13049 653 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CRHR2Q13324 411 aa9.55□□□□□ -0.88
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IGHV3-54-201ENST00000622166 CYTH1Q15438 398 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 TSNQ15631 228 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 FXNQ16595 210 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 EML3Q32P44 896 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 PITRM1Q5JRX3 1037 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 RGMBQ6NW40 437 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRR23BQ6ZRT6 265 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CHST9Q7L1S5 443 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 MYO1HQ8N1T3 1032 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 TTC30BQ8N4P2 665 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 FIBCD1Q8N539 461 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR7D4Q8NG98 312 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR4K2Q8NGD2 314 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR56A4Q8NGH8 313 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 GPR152Q8TDT2 470 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 HIC2Q96JB3 615 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 NSMCE3Q96MG7 304 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 KCNA7Q96RP8 456 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 GPR21Q99679 349 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CIB1Q99828 191 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC39A3Q9BRY0 314 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CCDC68Q9H2F9 335 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 GIMAP2Q9UG22 337 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 PCTPQ9UKL6 214 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 NOD1Q9Y239 953 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 BTRCQ9Y297 605 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 AK5Q9Y6K8 562 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa9.55□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 THSD7BQ9C0I4 1608 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 A0A087WXM4 84 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 A0A1B0GTW7 788 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ILVBLA1L0T0 632 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM234BA2RU67 622 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 KLHL33A6NCF5 533 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 C2orf81A6NN90 581 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 H3BSA7 217 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 H7C0S8 307 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CDC7O00311 574 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 AKAP10O43572 662 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 TLR5O60602 858 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CLDN11O75508 207 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CRCPO75575 148 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 RASAL1O95294 804 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 TSPAN12O95859 305 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CHEK2O96017 543 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 PIRTP0C851 137 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRSS56P0CW18 603 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CKMT2P17540 419 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 HTR1EP28566 365 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC5A2P31639 672 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 RGRP47804 291 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 TTPAP49638 278 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 FLT3LGP49771 235 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CCT8P50990 548 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 KCNQ1P51787 676 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 RPS6KA3P51812 740 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 KCNK10P57789 538 aa9.54□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ERVK-8P63133 956 aa9.54□□□□□ -0.88
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