RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.84■■□□□ 1.09
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SRRT-218ENST00000620394 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 NKD1Q969G9 470 aa21.84■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 TADA1Q96BN2 335 aa21.84■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 CCDC42Q96M95 316 aa21.84■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 TAAR9Q96RI9 348 aa21.84■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 ADGRE3Q9BY15 652 aa21.84■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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SRRT-218ENST00000620394 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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SRRT-218ENST00000620394 AMZ1Q400G9 498 aa21.83■■□□□ 1.09
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SRRT-218ENST00000620394 CATSPER2Q96P56 530 aa21.83■■□□□ 1.09
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SRRT-218ENST00000620394 RMI1Q9H9A7 625 aa21.83■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa21.82■■□□□ 1.08
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SRRT-218ENST00000620394 KRT1P04264 644 aa21.82■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 LIFP15018 202 aa21.82■■□□□ 1.08
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SRRT-218ENST00000620394 SLC1A1P43005 524 aa21.82■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 LIMK2P53671 638 aa21.82■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa21.82■■□□□ 1.08
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SRRT-218ENST00000620394 RCBTB1Q8NDN9 531 aa21.82■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 OR4D9Q8NGE8 314 aa21.82■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 CCHCR1Q8TD31 782 aa21.82■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 SLC37A2Q8TED4 501 aa21.82■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 CCDC74BQ96LY2 380 aa21.82■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 DPYSL5Q9BPU6 564 aa21.82■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 DDA1Q9BW61 102 aa21.82■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 BRD8Q9H0E9 1235 aa21.82■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 TSPY26PQ9H489 355 aa21.82■■□□□ 1.08
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SRRT-218ENST00000620394 NPNTQ6UXI9 565 aa21.81■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 NT5DC3Q86UY8 548 aa21.81■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 RHOT1Q8IXI2 618 aa21.81■■□□□ 1.08
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SRRT-218ENST00000620394 CEP41Q9BYV8 373 aa21.81■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 SLC25A51Q9H1U9 297 aa21.81■■□□□ 1.08
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SRRT-218ENST00000620394 FLNCQ14315 2725 aa21.81■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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SRRT-218ENST00000620394 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 AGBL5Q8NDL9 886 aa21.8■■□□□ 1.08
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SRRT-218ENST00000620394 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 CARD9Q9H257 536 aa21.8■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa21.8■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 MAGEE1Q9HCI5 957 aa21.8■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 KCNK4Q9NYG8 393 aa21.8■■□□□ 1.08
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SRRT-218ENST00000620394 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
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SRRT-218ENST00000620394 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa21.79■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 GPR89AB7ZAQ6 455 aa21.78■■□□□ 1.08
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