RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 GJA9P57773 515 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 SMARCB1Q12824 385 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 VMACQ2NL98 169 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 ADNP2Q6IQ32 1131 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 MYOCQ99972 504 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 UNC5CO95185 931 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 ELFN1P0C7U0 828 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF132P52740 706 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 COMTD1Q86VU5 262 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF227Q86WZ6 799 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A0J9YYE9 177 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 SOX10P56693 466 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC107Q8WV48 283 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 NXNL1Q96CM4 212 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 VCPIP1Q96JH7 1222 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 FABP12A6NFH5 140 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 LACTBL1A8MY62 500 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 NR4A1P22736 598 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 NARSO43776 548 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 VPS26BQ4G0F5 336 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM129CQ86XR2 697 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 XAGE5Q8WWM1 108 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 C8orf48Q96LL4 319 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 ZSWIM3Q96MP5 696 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 CORO1BQ9BR76 489 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 OR51V1Q9H2C8 321 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 GRB10Q13322 594 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 TCF25Q9BQ70 676 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC39A3Q9BRY0 314 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 TRPV4Q9HBA0 871 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 TAS2R7Q9NYW3 318 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 SHBGP04278 402 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 ARPC4P59998 168 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 PPATQ06203 517 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 SV2AQ7L0J3 742 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 GPR135Q8IZ08 494 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 MALT1Q9UDY8 824 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF649Q9BS31 505 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 E5RJQ4 531 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 TRMUO75648 421 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 AKAP3O75969 853 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 OGNP20774 298 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC26A2P50443 739 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 ANO7Q6IWH7 933 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A1B0GVC2 190 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 PITPNM1O00562 1244 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 ARP10275 920 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 CCR10P46092 362 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 S100A10P60903 97 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM124AQ86V42 546 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 UFD1Q92890 307 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 ABCD2Q9UBJ2 740 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 MAGI2Q86UL8 1455 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A0A0MRY4 1105 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 IFNA7P01567 189 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 PIRTP0C851 137 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 PTPRNQ16849 979 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 TUBA3EQ6PEY2 450 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 SPPL2CQ8IUH8 684 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 SPATA13Q96N96 652 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 AHCYP23526 432 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 KDELR1P24390 212 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 SMPDL3BQ92485 455 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 H3BRB1 525 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 KAT7O95251 611 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 ACVR2AP27037 513 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 STOMP27105 288 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-207ENST00000613246 RAB27AP51159 221 aa18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms