RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 SERPINB6P35237 376 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CDKN2BP42772 138 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CLCN2P51788 898 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 RAD51Q06609 339 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 BCL2L1Q07817 233 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 HORMAD1Q86X24 394 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKMY2Q8IV38 441 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SPATA22Q8NHS9 363 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 NETO1Q8TDF5 533 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC17A9Q9BYT1 436 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SEPT3Q9UH03 358 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 OR1A2Q9Y585 309 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PPM1 405 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 AGRPO00253 132 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 LRP3O75074 770 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 THEGLP0DJG4 465 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 NIPAL4Q0D2K0 466 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 OLIG2Q13516 323 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PDK2Q15119 407 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 NOMO1Q15155 1222 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC1A5Q15758 541 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 DBN1Q16643 649 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF449Q6P9G9 518 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PACS1Q6VY07 963 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 RD3Q7Z3Z2 195 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CNTD1Q8N815 330 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC8CQ8TDW0 803 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 DENND1AQ8TEH3 1009 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 MPP4Q96JB8 637 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TTC25Q96NG3 672 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF570Q96NI8 536 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC37BQ96QE4 947 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PSKH2Q96QS6 385 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 FOXP3Q9BZS1 431 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TM7SF3Q9NS93 570 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TXLNGQ9NUQ3 528 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 HAO1Q9UJM8 370 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ALOX15BO15296 676 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 FFAR2O15552 330 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 OPHN1O60890 802 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 RACK1P63244 317 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 GALNT2Q10471 571 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SGCGQ13326 291 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 RCOR2Q8IZ40 523 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 HDAC8Q9BY41 377 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ABCG8Q9H221 673 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 K7ESM1 405 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC30A4O14863 429 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP12.49□□□□□ -0.415e-6■□□□□ 8.1
RABGEF1-209ENST00000607882 LATO43561 262 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CD86P42081 329 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 GALNT3Q14435 633 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP12.49□□□□□ -0.412e-6■■■□□ 14.6
RABGEF1-209ENST00000607882 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 Q6ZSR6 202 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP128Q6ZU80 1094 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 LZTR1Q8N653 840 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PLA2G15Q8NCC3 412 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 FEM1CQ96JP0 617 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 UCKL1Q9NWZ5 548 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SUSD2Q9UGT4 822 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 USH1CQ9Y6N9 552 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TLR4O00206 839 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PCCBP05166 539 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CD59P13987 128 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SERPINA4P29622 427 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 C1orf61Q13536 156 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 MORF4L2Q15014 288 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 OASLQ15646 514 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PDK4Q16654 411 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 RBFAQ8N0V3 343 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP76Q8TAP6 659 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 BMFQ96LC9 184 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 B4GALT6Q9UBX8 382 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDH15Q96QU1 1955 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PR77 199 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 EDF1O60869 148 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CBX6O95503 412 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 C6P13671 934 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 KRT4P19013 534 aa12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms