RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKS6Q68DC2 871 aa11.71□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYVN1Q86TM6 617 aa11.71□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADCY4Q8NFM4 1077 aa11.71□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUDT8Q8WV74 236 aa11.71□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CANT1Q8WVQ1 401 aa11.71□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1orf50Q9BV19 199 aa11.71□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COQ10BQ9H8M1 238 aa11.71□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa11.71□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYO7AQ13402 2215 aa11.71□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1B0GTW7 788 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1B0GVM2 712 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A8MX80 341 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TIPRLO75663 272 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PKMP14618 531 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NELFEP18615 380 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GKP32189 559 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PSMD8P48556 350 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TUFMP49411 452 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACADVLP49748 655 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZXDBP98169 803 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMARCB1Q12824 385 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP41Q3LFD5 358 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM117BQ6P1L5 589 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MIER2Q8N344 545 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WFDC5Q8TCV5 224 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AUTS2Q8WXX7 1259 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINGO1Q96FE5 620 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC29A1Q99808 456 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CIB1Q99828 191 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POPDC3Q9HBV1 291 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MTRRQ9UBK8 725 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHF24Q9UPV7 400 aa11.71□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H0Y626 953 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DENRO43583 198 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TBL1XO60907 577 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP6V1B1P15313 513 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CKMT2P17540 419 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ITGB6P18564 788 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UGT1A6P19224 532 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP6V1B2P21281 511 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CA5AP35218 305 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BFSP2Q13515 415 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IFNEQ86WN2 208 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MARVELD2Q8N4S9 558 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR52B6Q8NGF0 335 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD200R1Q8TD46 325 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HGH1Q9BTY7 390 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLAMF8Q9P0V8 285 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANGPT2O15123 496 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TPST1O60507 370 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C8BP07358 591 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPATA31D3P0C874 917 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LBPP18428 481 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HOXD10P28358 340 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CASP2P42575 452 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SEMG2Q02383 582 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NOGQ13253 232 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBBP7Q16576 425 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CNPY1Q3B7I2 92 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAP7D1Q3KQU3 841 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DHFR2Q86XF0 187 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC15A3Q8IY34 581 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDYL2Q8N8U2 506 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR2T11Q8NH01 316 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNAJB14Q8TBM8 379 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COMMD8Q9NX08 183 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLK2Q9NYY3 685 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD274Q9NZQ7 290 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RIMKLBQ9ULI2 386 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 E5RI56 91 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FXYD1O00168 92 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VPS26AO75436 327 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BAIAP3O94812 1187 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FESP07332 822 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMIM18P0DKX4 95 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GSTT1P30711 240 aa11.7□□□□□ -0.54
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms