RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586792.5

ZNF540-204, Transcript of zinc finger protein 540, human

TSL 3 BASIC

Gene ZNF540, Length 564 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF540-204	ENST00000586792	TNFSF4	P23510	183 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	YWHAQ	P27348	245 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	VIPR2	P41587	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CCR2	P41597	374 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	MAGEA9	P43362	315 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	LSS	P48449	732 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	PPP3CC	P48454	512 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	IFNAR2	P48551	515 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	NDST1	P52848	882 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	MAPK10	P53779	464 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CDH8	P55286	799 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	GPC5	P78333	572 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	IFT88	Q13099	833 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ODF1	Q14990	250 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	MEA1	Q16626	185 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	KAZN	Q674X7	775 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	VIT	Q6UXI7	678 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	UNC93A	Q86WB7	457 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	NUP93	Q8N1F7	819 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	MIER2	Q8N344	545 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	FBXO32	Q969P5	355 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	NACC2	Q96BF6	587 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	RAB20	Q9NX57	234 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	MUC3A	Q02505	3323 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792		A0A087X0M5	115 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792		A0A1B0GX30	115 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ERICH4	A6NGS2	130 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792		H7C0S8	307 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CHAD	O15335	359 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	MPPED1	O15442	326 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	AHCYL1	O43865	530 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	NTN1	O95631	604 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	MBD3	O95983	291 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CD19	P15391	556 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	HDC	P19113	662 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	FCAR	P24071	287 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	PEX2	P28328	305 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ADORA2B	P29275	332 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	FMO5	P49326	533 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	STX17	P56962	302 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	MAP3K7CL	P57077	242 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	DCAF7	P61962	342 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms