RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584692.1

RHOT1-216, Transcript of ras homolog family member T1, human

TSL 2

Gene RHOT1, Length 680 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RHOT1-216	ENST00000584692	NAB2	Q15742	525 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RHOT1-216	ENST00000584692	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RHOT1-216	ENST00000584692	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RHOT1-216	ENST00000584692	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RHOT1-216	ENST00000584692	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RHOT1-216	ENST00000584692	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RHOT1-216	ENST00000584692	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RHOT1-216	ENST00000584692	GPR180	Q86V85	440 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RHOT1-216	ENST00000584692	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RHOT1-216	ENST00000584692	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RHOT1-216	ENST00000584692	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RHOT1-216	ENST00000584692	EGLN2	Q96KS0	407 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RHOT1-216	ENST00000584692	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RHOT1-216	ENST00000584692	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RHOT1-216	ENST00000584692	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RHOT1-216	ENST00000584692	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RHOT1-216	ENST00000584692	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RHOT1-216	ENST00000584692	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RHOT1-216	ENST00000584692		A0A087WYN8	130 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692		A0A1W2PP11	408 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	ANKRD28	O15084	1053 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	KRT86	O43790	486 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	ICAM1	P05362	532 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	CD53	P19397	219 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	ACADL	P28330	430 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	ARL3	P36405	182 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	RXRG	P48443	463 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	ISL1	P61371	349 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	GTF2H2	Q13888	395 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	KRT81	Q14533	505 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	PDILT	Q8N807	584 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	USP6NL	Q92738	828 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	PIGM	Q9H3S5	423 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	FKRP	Q9H9S5	495 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	CTAGE9	A4FU28	777 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	WDR1	O75083	606 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	UMOD	P07911	640 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	CTAGE8	P0CG41	777 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	FAM106CP	P0CH98	169 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	ACADM	P11310	421 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	RARG	P13631	454 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	TM4SF1	P30408	202 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	MAPK4	P31152	587 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	PRAME	P78395	509 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	NODAL	Q96S42	347 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	MAP2K7	O14733	419 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	OR2C1	O95371	312 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RHOT1-216	ENST00000584692	CETP	P11597	493 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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