RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583514.5

LLGL2-221, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, human

TSL 3

Gene LLGL2, Length 409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LLGL2-221	ENST00000583514	FGG	P02679	453 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	PLA2G2A	P14555	144 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	TEAD1	P28347	426 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	ADCY8	P40145	1251 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	ETV5	P41161	510 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	GPR1	P46091	355 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	ARSE	P51690	589 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	PTS	Q03393	145 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	DPT	Q07507	201 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	C2orf54	Q08AI8	447 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	GALNT2	Q10471	571 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	BIRC2	Q13490	618 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	IHH	Q14623	411 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	USP53	Q70EK8	1073 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	PIM3	Q86V86	326 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	IFT20	Q8IY31	132 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	KCTD6	Q8NC69	237 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	PATE1	Q8WXA2	126 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	SCAMP4	Q969E2	229 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	AP2M1	Q96CW1	435 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	CMKLR1	Q99788	373 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	ABCG8	Q9H221	673 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514		A0A0J9YYE9	177 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	MATN3	O15232	486 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	PRAMEF10	O60809	474 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	CPNE6	O95741	557 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	SOD1	P00441	154 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	TRBC1	P01850	177 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	IVL	P07476	585 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	KRT7	P08729	469 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	PTPN7	P35236	360 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	MAPK10	P53779	464 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	EPHB1	P54762	984 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	DSC2	Q02487	901 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	CYP1B1	Q16678	543 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	TRIM74	Q86UV6	250 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	MAML1	Q92585	1016 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	KRT35	Q92764	455 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	USP7	Q93009	1102 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	TMEM159	Q96B96	161 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	AGAP2	Q99490	1192 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	CHKB	Q9Y259	395 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LLGL2-221	ENST00000583514	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	FAM187A	A6NFU0	413 aa		15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	CAPN8	A6NHC0	703 aa		15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	CES1	P23141	567 aa		15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	CD1C	P29017	333 aa		15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	ACTR1B	P42025	376 aa		15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	TAS2R40	P59535	323 aa		15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	ACTR1A	P61163	376 aa		15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	NAGS	Q8N159	534 aa		15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	CDH19	Q9H159	772 aa		15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		15.45	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		15.44	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	PPM1D	O15297	605 aa		15.44	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	INPP4B	O15327	924 aa		15.44	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	ZW10	O43264	779 aa		15.44	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	PRL	P01236	227 aa		15.44	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	LIPC	P11150	499 aa		15.44	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	PYGM	P11217	842 aa		15.44	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	ZNF30	P17039	623 aa		15.44	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	CCNC	P24863	283 aa		15.44	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	FNTA	P49354	379 aa		15.44	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	STC1	P52823	247 aa		15.44	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	GBE1	Q04446	702 aa		15.44	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		15.44	■□□□□ 0.06
LLGL2-221	ENST00000583514	PEX6	Q13608	980 aa		15.44	■□□□□ 0.06

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