RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	OLAH	Q9NV23	265 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	BTRC	Q9Y297	605 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	MED16	Q9Y2X0	877 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CENPF	P49454	3210 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0D9SEW6	157 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	MTMR11	A4FU01	709 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ACSL4	O60488	711 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TMCC1	O94876	653 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SLC11A2	P49281	568 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	FLT3LG	P49771	235 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	OXCT1	P55809	520 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	MYRFL	Q96LU7	910 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	GPR21	Q99679	349 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	AIG1	Q9NVV5	245 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PDLIM1	O00151	329 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SOCS2	O14508	198 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	KDELR3	O43731	214 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	NPPA	P01160	153 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PTPRN	Q16849	979 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	GABRQ	Q9UN88	632 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	VWA8	A3KMH1	1905 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	BTN3A1	O00481	513 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ARPC2	O15144	300 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SNX2	O60749	519 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	EED	O75530	441 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	UMPS	P11172	480 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ALDH3B2	P48448	385 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SCNN1B	P51168	640 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	KCNQ1	P51787	676 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	DIO3	P55073	304 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	NFYC	Q13952	458 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	XKR7	Q5GH72	579 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	RGMB	Q6NW40	437 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TRPV3	Q8NET8	790 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	HGH1	Q9BTY7	390 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SPON2	Q9BUD6	331 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SUN2	Q9UH99	717 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PCTP	Q9UKL6	214 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	GBF1	Q92538	1859 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CDC7	O00311	574 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CLDN11	O75508	207 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SLC22A3	O75751	556 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PRSS56	P0CW18	603 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CLCN4	P51793	760 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	IL2	P60568	153 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ABI1	Q8IZP0	508 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CBR4	Q8N4T8	237 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	OR7D4	Q8NG98	312 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	BIRC8	Q96P09	236 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ALG2	Q9H553	416 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	RRAGC	Q9HB90	399 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	BMP10	O95393	424 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CR2	P20023	1033 aa		18.26	■□□□□ 0.51

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