RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560983.1

HERC1-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene HERC1, Length 457 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-211ENST00000560983 CNTN5O94779 1100 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 MATN4O95460 622 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 PRKAR1AP10644 381 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 CD99P14209 185 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 GOT1P17174 413 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 IFNAR1P17181 557 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 RPA1P27694 616 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 ECHS1P30084 290 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 HLA-FP30511 346 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 SLC8A1P32418 973 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 PTPN7P35236 360 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 UGT1A3P35503 534 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 LHX1P48742 406 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 HDAC4P56524 1084 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
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HERC1-211ENST00000560983 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 FOXF2Q12947 444 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 MAPK7Q13164 816 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 TMEM132DQ14C87 1099 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 E2F5Q15329 346 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
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HERC1-211ENST00000560983 CYP2A13Q16696 494 aa3.85□□□□□ -1.79
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HERC1-211ENST00000560983 C9orf64Q5T6V5 341 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 GALNT17Q6IS24 598 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 C4orf50Q6ZRC1 276 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 MED25Q71SY5 747 aa3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
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HERC1-211ENST00000560983 SLC35F3Q8IY50 421 aa3.85□□□□□ -1.79
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HERC1-211ENST00000560983 Q8NA96 180 aa3.85□□□□□ -1.79
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HERC1-211ENST00000560983 C19orf60Q96EN9 201 aa3.85□□□□□ -1.79
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HERC1-211ENST00000560983 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 MYOFQ9NZM1 2061 aa3.85□□□□□ -1.79
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HERC1-211ENST00000560983 STAB1Q9NY15 2570 aa3.84□□□□□ -1.79
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HERC1-211ENST00000560983 TBC1D3EA0A087X179 549 aa3.84□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa3.84□□□□□ -1.79
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HERC1-211ENST00000560983 IGLV2-14P01704 120 aa3.84□□□□□ -1.79
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HERC1-211ENST00000560983 PDGFRBP09619 1106 aa3.84□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 TBC1D3HP0C7X1 549 aa3.84□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 CCL4P13236 92 aa3.84□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 MTHFD2P13995 350 aa3.84□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 ITGA3P26006 1051 aa3.84□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 ANXA13P27216 316 aa3.84□□□□□ -1.79
HERC1-211ENST00000560983 PCSK1P29120 753 aa3.84□□□□□ -1.79
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