RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559463.5

RPL28-208, Transcript of ribosomal protein L28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPL28, Length 852 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28-208ENST00000559463 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 PMS2P1A4D2B8 440 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 ANXA9O76027 345 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 EML2O95834 649 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 PNLIPP16233 465 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 GEMP55040 296 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 LRP8Q14114 963 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 PDPK2PQ6A1A2 396 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 ARL14Q8N4G2 192 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 GLYATL1Q969I3 302 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 FERMT1Q9BQL6 677 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 OR2AG1Q9H205 316 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 CARD9Q9H257 536 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 TRABDQ9H4I3 376 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 RMI1Q9H9A7 625 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 IL17CQ9P0M4 197 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 SATB2Q9UPW6 733 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-208ENST00000559463 ATMQ13315 3056 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 KRT86O43790 486 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 NUAK1O60285 661 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 ACP5P13686 325 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 LSSP48449 732 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 GDF10P55107 478 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 CCZ1BP86790 482 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 B4GALNT1Q00973 533 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 NR1D2Q14995 579 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 C3orf38Q5JPI3 329 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 RANBP10Q6VN20 620 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 SLC35B2Q8TB61 432 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 GRAMD1AQ96CP6 724 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 VPS35Q96QK1 796 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 APOL2Q9BQE5 337 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 FOXP3Q9BZS1 431 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 TRIM39Q9HCM9 518 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 IL26Q9NPH9 171 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 ASCL3Q9NQ33 180 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 HACD3Q9P035 362 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 KCNK6Q9Y257 313 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 A0A087WV48 116 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 A6NCN8 305 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 C5orf60A6NFR6 353 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 CHUKO15111 745 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 GPR39O43194 453 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 GRID2O43424 1007 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 B4GAT1O43505 415 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 BUD23O43709 281 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 MTX2O75431 263 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 DXOO77932 396 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 STK10O94804 968 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 PTMAP06454 111 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 CA5AP35218 305 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 OR1D5P58170 312 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 PEX6Q13608 980 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 PTPRCAPQ14761 206 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 FAM71DQ8N9W8 422 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 TTC13Q8NBP0 860 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 TBC1D29Q9UFV1 150 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 ARL5AQ9Y689 179 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 RHPN2P1A8MT19 583 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 GPR89AB7ZAQ6 455 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 PPM1DO15297 605 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 GPR89BP0CG08 455 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 CCKBRP32239 447 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 ACTN2P35609 894 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 SPAM1P38567 509 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 SPARCL1Q14515 664 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 CHRNA6Q15825 494 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 SDK2Q58EX2 2172 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 DENND5AQ6IQ26 1287 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 C19orf48Q6RUI8 117 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 IGF2-ASQ6U949 168 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL28-208ENST00000559463 FAM151BQ6UXP7 276 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms