RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557076.5

SCFD1-223, Transcript of sec1 family domain containing 1, human

TSL 3

Gene SCFD1, Length 743 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCFD1-223	ENST00000557076	BLK	P51451	505 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	NEK4	P51957	841 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC8A3	P57103	927 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	YPEL5	P62699	121 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	PPARD	Q03181	441 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CDC20	Q12834	499 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	SGCG	Q13326	291 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	BIRC3	Q13489	604 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	C1orf61	Q13536	156 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	ELOC	Q15369	112 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	DCAF6	Q58WW2	860 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	PIM3	Q86V86	326 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	PIGZ	Q86VD9	579 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	DDA1	Q9BW61	102 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	GPR34	Q9UPC5	381 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	HEATR9	A2RTY3	570 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076		B4E171	279 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	ACOT7	O00154	380 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	B4GAT1	O43505	415 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	AP1G1	O43747	822 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	DUX1	O43812	170 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	RAD1	O60671	282 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	TCN2	P20062	427 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	TSPAN7	P41732	249 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	ETV4	P43268	484 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	PEX5	P50542	639 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	HK3	P52790	923 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	TBX4	P57082	545 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	ZACN	Q401N2	412 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	GPR156	Q8NFN8	814 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	ALG14	Q96F25	216 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.76	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms