RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556210.1

CUX1-215, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CUX1, Length 4,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-215ENST00000556210 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 ACSL4O60488 711 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 URODP06132 367 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 HMGCS1Q01581 520 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 ZNF697Q5TEC3 545 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 TXNDC8Q6A555 127 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 C11orf74Q86VG3 221 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 ITFG2Q969R8 447 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 KATNBL1Q9H079 304 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 ARMC7Q9H6L4 198 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 CAPN1P07384 714 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 TMED10P49755 219 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 HPCAP84074 193 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 PFKPQ01813 784 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 MYLK3Q32MK0 819 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 CST9Q5W186 159 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 RIN3Q8TB24 985 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 DGCR6LQ9BY27 220 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 ALG2Q9H553 416 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 A0A087WXM4 84 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 LRG1P02750 347 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 MAGEA6P43360 314 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 TUFMP49411 452 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 OCA2Q04671 838 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 BFSP2Q13515 415 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 KIF17Q9P2E2 1029 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 SLC7A4O43246 635 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 LDLRP01130 860 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 FOXA1P55317 472 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 BRSK1Q8TDC3 778 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 UROC1Q96N76 676 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 ATG10Q9H0Y0 220 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 SNX5Q9Y5X3 404 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 MAN1A2O60476 641 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 IL1BP01584 269 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 NNMTP40261 264 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 CASP9P55211 416 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 SYTL3Q4VX76 610 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 FAM91A1Q658Y4 838 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 LRRC8DQ7L1W4 858 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 C11orf96Q7Z7L8 435 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 RASAL3Q86YV0 1011 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 TRPV1Q8NER1 839 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 GANCQ8TET4 914 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 OPTCQ9UBM4 332 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 INSIG1O15503 277 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 SLC11A1P49279 550 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 GPR107Q5VW38 600 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 RETSATQ6NUM9 610 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 AHI1Q8N157 1196 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 KDM1BQ8NB78 822 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 CORO1BQ9BR76 489 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 OSBPL11Q9BXB4 747 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 RNF186Q9NXI6 227 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 UPK3BL1B0FP48 263 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 UPK3BL2E5RIL1 263 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 ECI2O75521 394 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 SLC22A3O75751 556 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 ITPKAP23677 461 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 GABRR2P28476 465 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 CPOXP36551 454 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 C21orf59P57076 290 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 CRY1Q16526 586 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 RTP2Q5QGT7 225 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 SPESP1Q6UW49 350 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 RANBP10Q6VN20 620 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 ZNF366Q8N895 744 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 ITFG1Q8TB96 612 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 PNPLA3Q9NST1 481 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 K7ERQ8 282 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 PRAMEF1O95521 474 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 CCR3P51677 355 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 EPHB3P54753 998 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 NAA20P61599 178 aa14.74□□□□□ -0.05
CUX1-215ENST00000556210 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms