RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550261.5

PPP1CC-205, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 5

Gene PPP1CC, Length 747 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-205	ENST00000550261	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.36	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	MYO7A	Q13402	2215 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	SYCE3	A1L190	88 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	TPM1	P09493	284 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	CSH1	P0DML2	217 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	CSH2	P0DML3	217 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	VDR	P11473	427 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	MYOG	P15173	224 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	UCHL3	P15374	230 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	PON1	P27169	355 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	ACADSB	P45954	432 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	TUB	P50607	506 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	RENBP	P51606	427 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZNF132	P52740	706 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	MYL6	P60660	151 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	UBXN1	Q04323	297 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	DAG1	Q14118	895 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	KRT31	Q15323	416 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	CBWD6	Q4V339	395 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	WSCD1	Q658N2	575 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	ARC	Q7LC44	396 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	SHC3	Q92529	594 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	SUSD6	Q92537	303 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	RITA1	Q96K30	269 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	GUCD1	Q96NT3	240 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	PKMYT1	Q99640	499 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	LHX5	Q9H2C1	402 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	CISH	Q9NSE2	258 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	IL37	Q9NZH6	218 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	GCNT4	Q9P109	453 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261		A8MXQ7	604 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	AGPS	O00116	658 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	PPP6C	O00743	305 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	THAP12	O43422	761 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	SPRY2	O43597	315 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	USP1	O94782	785 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	SERPINC1	P01008	464 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	TUBB4A	P04350	444 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	GZMA	P12544	262 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	CD19	P15391	556 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	CREB1	P16220	341 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	CDC25C	P30307	473 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PPP1CC-205	ENST00000550261	OR1D2	P34982	312 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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