RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	15.61	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		15.61	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		15.61	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	LAMA3	Q16787	3333 aa		15.61	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	MOSPD3	O75425	235 aa		15.61	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	RBP1	P09455	135 aa		15.61	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	15.61	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	IRS1	P35568	1242 aa		15.61	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	MS4A2	Q01362	244 aa		15.61	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	15.61	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		15.61	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		15.61	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	CATSPER2	Q96P56	530 aa		15.61	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		15.61	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		15.61	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	NEMP2	A6NFY4	417 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	PIGN	O95427	931 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	FGF19	O95750	216 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	RHO	P08100	348 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	SYN1	P17600	705 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	PFKP	Q01813	784 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	KY	Q8NBH2	561 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	LRGUK	Q96M69	825 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	POMK	Q9H5K3	350 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	HACD3	Q9P035	362 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	PGLS	O95336	258 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	TFAP2A	P05549	437 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	DNAJB13	P59910	316 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	CAMK1	Q14012	370 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	RTL10	Q7L3V2	364 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	LSMEM2	Q8N112	164 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	LILRA2	Q8N149	483 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	LPGAT1	Q92604	370 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	MYO19	Q96H55	970 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	BTBD9	Q96Q07	612 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	TCF12	Q99081	682 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	PRAMEF12	O95522	483 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	CLPTM1	O96005	669 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	THRA	P10827	490 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	EPCAM	P16422	314 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	CTPS1	P17812	591 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	TFEB	P19484	476 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	KCNA5	P22460	613 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	HLA-F	P30511	346 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	MC4R	P32245	332 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	DPP6	P42658	865 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	SUOX	P51687	545 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	UBE3A	Q05086	875 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	CEACAM7	Q14002	265 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM25	Q86YD3	366 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	LMLN	Q96KR4	655 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	TDP1	Q9NUW8	608 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	MATN2	O00339	956 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	PEX1	O43933	1283 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	NDUFS3	O75489	264 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	FMO4	P31512	558 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	GK	P32189	559 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	PLK1	P53350	603 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	BCL2L1	Q07817	233 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	PRKAA1	Q13131	559 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	ISCA2	Q86U28	154 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	HIC2	Q96JB3	615 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	ALG9	Q9H6U8	611 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF711	Q9Y462	761 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GRSF1-208	ENST00000545193	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		15.58	■□□□□ 0.08

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms