RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530513.5

PACSIN3-207, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-207ENST00000530513 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 NKX2-8O15522 239 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 PRKAR1AP10644 381 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 F3P13726 295 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 CD86P42081 329 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 EPHA4P54764 986 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 TAS2R40P59535 323 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM182AQ5T1J6 154 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 KCTD6Q8NC69 237 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM83DQ9H4H8 585 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 PKD2L2Q9NZM6 624 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 CCR10P46092 362 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 CDC20Q12834 499 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 GALNT3Q14435 633 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 NFKBIBQ15653 356 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 CEACAM20Q6UY09 585 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC9B2Q86UD5 537 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 EID2BQ96D98 161 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 HDAC11Q96DB2 347 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 BRD8Q9H0E9 1235 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 EPN3Q9H201 632 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 RMI1Q9H9A7 625 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 DTLQ9NZJ0 730 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 ATXN10Q9UBB4 475 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 NENFQ9UMX5 172 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 KCNK1O00180 336 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 GRID2O43424 1007 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 NUAK1O60285 661 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 STK17BO94768 372 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 PROSCO94903 275 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 GYPCP04921 128 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 GFERP55789 205 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 UBASH3AP57075 661 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 ZBTB17Q13105 803 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 SH3KBP1Q96B97 665 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 RNF31Q96EP0 1072 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 CATSPER2Q96P56 530 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 CARD9Q9H257 536 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 PRDM8Q9NQV8 689 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 FBXO8Q9NRD0 319 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 CPNE7Q9UBL6 633 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 TUBD1Q9UJT1 453 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 A0A0G2JNG1 304 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 ANKRD66B4E2M5 251 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 KIR2DS3K7RE56 304 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 DLGAP3O95886 979 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 JCHAINP01591 159 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC2A4P14672 509 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 MX2P20592 715 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 OAS2P29728 719 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 ZBED6P86452 979 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 KIR2DS5Q14953 304 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 PDK2Q15119 407 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 ALS2CLQ60I27 953 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 CNTD1Q8N815 330 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 CCNYQ8ND76 341 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 CCHCR1Q8TD31 782 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 ZPBPQ9BS86 351 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 OR2AG1Q9H205 316 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 LILRA5A6NI73 299 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC4A1P02730 911 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-207ENST00000530513 MAN1A1P33908 653 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF569Q5MCW4 686 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-207ENST00000530513 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-207ENST00000530513 CRTC3Q6UUV7 619 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-207ENST00000530513 STARD8Q92502 1023 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-207ENST00000530513 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-207ENST00000530513 CEP41Q9BYV8 373 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-207ENST00000530513 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-207ENST00000530513 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-207ENST00000530513 KLC4Q9NSK0 619 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-207ENST00000530513 OGFRQ9NZT2 677 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-207ENST00000530513 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-207ENST00000530513 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms