RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 TTC4O95801 387 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 FAM153BP0C7A2 387 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 TSHRP16473 764 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 MAGEA4P43358 317 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 SPINT3P49223 89 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 PPP2CBP62714 309 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 PPP2CAP67775 309 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 CFHR1Q03591 330 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 SLMAPQ14BN4 828 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 ZNF284Q2VY69 593 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 FAM153CQ494X1 144 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 DENND2CQ68D51 928 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 NLRP8Q86W28 1048 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 ZBED8Q8IZ13 594 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 FBXO36Q8NEA4 188 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 CADM4Q8NFZ8 388 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 OR4K2Q8NGD2 314 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 SGSM3Q96HU1 749 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 ZNF778Q96MU6 729 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 PKD2L2Q9NZM6 624 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 CHMP2BQ9UQN3 213 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 PKP3Q9Y446 797 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 TBC1D3EA0A087X179 549 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 IGLON5A6NGN9 336 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 GOLGA8CPA6NN73 597 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 TBC1D3LB9A6J9 549 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 WNT9AO14904 365 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 TM7SF2O76062 418 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 IGHV4-34P06331 123 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 POLBP06746 335 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 GSTA2P09210 222 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 TBC1D3HP0C7X1 549 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 ZNF883P0CG24 379 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 BPIP17213 487 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 NMBRP28336 390 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 NUDT1P36639 197 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 HADHAP40939 763 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 CLDN6P56747 220 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 DPTQ07507 201 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 FGL2Q14314 439 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 CRYMQ14894 314 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 SKIDA1Q1XH10 827 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 SPANXN3Q5MJ09 141 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 SEL1L3Q68CR1 1132 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 KIAA0895LQ68EN5 471 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 CASC4Q6P4E1 433 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 EMBQ6PCB8 327 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 UNC5AQ6ZN44 842 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 CCDC25Q86WR0 208 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 OR13C4Q8NGS5 318 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 SEMA4CQ9C0C4 833 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 TM7SF3Q9NS93 570 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 FAM169AQ9Y6X4 670 aa16.73■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 BUD23O43709 281 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 ARNTP27540 789 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 ETV3P41162 512 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 ARSDP51689 593 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 XIAPP98170 497 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 PTPRCAPQ14761 206 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 ACOX1Q15067 660 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 Q6ZVL8 140 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 ANKMY2Q8IV38 441 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 RGL4Q8IZJ4 473 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 GALNT15Q8N3T1 639 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 GPR26Q8NDV2 337 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 DENND6BQ8NEG7 585 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 PYROXD1Q8WU10 500 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 DNASE2BQ8WZ79 361 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 CAVIN3Q969G5 261 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 MFSD3Q96ES6 412 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 GPR174Q9BXC1 333 aa16.72■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 SLC17A9Q9BYT1 436 aa16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms