RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 FUT8Q9BYC5 575 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ACRV1P26436 265 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 AKT2P31751 481 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 B4GALNT1Q00973 533 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 LPAL2Q16609 132 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 KCTD16Q68DU8 428 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CNTN4Q8IWV2 1026 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM145Q8NBT3 493 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR150Q8NGU9 434 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CDKL2Q92772 493 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 SGSM3Q96HU1 749 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF446Q9NWS9 450 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 VPS18Q9P253 973 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 NFS1Q9Y697 457 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 PRSS21Q9Y6M0 314 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 AGAP14A8MT82 685 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ITPKAP23677 461 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 POLD2P49005 469 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CDK3Q00526 305 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC6Q86X45 466 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 RGL4Q8IZJ4 473 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ACVR1CQ8NER5 493 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 NELL1Q92832 810 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM136AQ96C01 138 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ZIM3Q96PE6 472 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 PAFAH2Q99487 392 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR26Q9H7D7 661 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ZSCAN32Q9NX65 697 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 SCN8AQ9UQD0 1980 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 FPGTO14772 594 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 NDUFS3O75489 264 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 AKT1P31749 480 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR33Q49SQ1 333 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 LPCAT2Q7L5N7 544 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 IQCKQ8N0W5 287 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CALML6Q8TD86 181 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ASB12Q8WXK4 309 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 NDNQ99608 321 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 R4GN57 208 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 TLDC2A0PJX2 215 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 FOXO6A8MYZ6 492 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 SCAMP1O15126 338 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 TYSND1Q2T9J0 566 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 PLK5Q496M5 336 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 PACS1Q6VY07 963 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 CEP68Q76N32 757 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 HIC2Q96JB3 615 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 APOOQ9BUR5 198 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 TBK1Q9UHD2 729 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 NUDT17P0C025 328 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 CD27P26842 260 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 FMO4P31512 558 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM23P36406 574 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 BMPR2Q13873 1038 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 NLRP8Q86W28 1048 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 OR13H1Q8NG92 308 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.192e-6■■■■■ 45.2
TSNARE1-208ENST00000524325 SGF29Q96ES7 293 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 COPS8Q99627 209 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 OR2AG1Q9H205 316 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 PRKAB1Q9Y478 270 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 EML5Q05BV3 1969 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 IQCF5A8MTL0 148 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 SASH3O75995 380 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 ASMTLO95671 621 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 OGNP20774 298 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 MSH2P43246 934 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 STAT4Q14765 748 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHL38Q2WGJ6 581 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 Q6ZSR6 202 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC44A1Q8WWI5 657 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 LPGAT1Q92604 370 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 VPS35Q96QK1 796 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 TEX101Q9BY14 249 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 SMOXQ9NWM0 555 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM202A6NGA9 273 aa22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 TTPAP49638 278 aa22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF844Q08AG5 666 aa22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF528Q3MIS6 628 aa22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms