RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	ARL5A	Q9Y689	179 aa		8.01	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		8.01	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		8.01	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193		A8MT66	165 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	SERPINI2	O75830	405 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	PRKCG	P05129	697 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	CDH15	P55291	814 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	NAA20	P61599	178 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	SEMG2	Q02383	582 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	PRKCQ	Q04759	706 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	AMER2	Q8N7J2	671 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	POC5	Q8NA72	575 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	TADA1	Q96BN2	335 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	ITCH	Q96J02	903 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	FES	P07332	822 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	PAX3	P23760	479 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	SCNN1A	P37088	669 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	MAPK8	P45983	427 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	OR10A6	Q8NH74	314 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	MYO19	Q96H55	970 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	CHID1	Q9BWS9	393 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	ASNA1	O43681	348 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	ACSL4	O60488	711 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	NBN	O60934	754 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	THRB	P10828	461 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	MTPN	P58546	118 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	PIM3	Q86V86	326 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	STARD8	Q92502	1023 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	NELL1	Q92832	810 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	RNFT2	Q96EX2	444 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	GPR22	Q99680	433 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	MIPEP	Q99797	713 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	PKP2	Q99959	881 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	FAM25A	B3EWG3	89 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	FAM25C	B3EWG5	89 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	FAM25G	B3EWG6	89 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193		J3KR12	359 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	EI24	O14681	340 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	MYL12B	O14950	172 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	H6PD	O95479	791 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	PRAMEF1	O95521	474 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	UGT2B4	P06133	528 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	GPI	P06744	558 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	UROS	P10746	265 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	GABRR2	P28476	465 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	GGT5	P36269	586 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	KIR3DL1	P43629	444 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	CCL14	Q16627	93 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	NADK2	Q4G0N4	442 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	SDE2	Q6IQ49	451 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	EPGN	Q6UW88	154 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	MTSS1L	Q765P7	747 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF558	Q96NG5	402 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	SMO	Q99835	787 aa		8	□□□□□ -1.13
NEK1-208	ENST00000512193	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		8	□□□□□ -1.13

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