RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511362.5

ATXN3-211, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 3

Gene ATXN3, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 REC8O95072 547 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 GOSR1O95249 250 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 POP4O95707 220 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TOMM40O96008 361 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 UQCRHP07919 91 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CD63P08962 238 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 THEGLP0DJG4 465 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ARP10275 920 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ST6GAL1P15907 406 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM11P17152 192 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TFEBP19484 476 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ELF1P32519 619 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SLC16A2P36021 539 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 HAAOP46952 286 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 THBS3P49746 956 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 VPS41P49754 854 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 HTR6P50406 440 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PSMD7P51665 324 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 HMGCS2P54868 508 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PLTPP55058 493 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 DR1Q01658 176 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SIGLEC14Q08ET2 396 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 KLHL30Q0D2K2 578 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TCP10Q12799 353 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 BECN1Q14457 450 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 KCNJ12Q14500 433 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CEP55Q53EZ4 464 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CCDC183Q5T5S1 534 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF600Q6ZNG1 722 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 LPCAT2Q7L5N7 544 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 NUP54Q7Z3B4 507 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 VSIG1Q86XK7 387 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 NKAIN4Q8IVV8 208 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SPATA5Q8NB90 893 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 BBOF1Q8ND07 529 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TRPV1Q8NER1 839 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PHKBQ93100 1093 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 LRRC46Q96FV0 321 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PSKH2Q96QS6 385 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 RMDN3Q96TC7 470 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 MPHOSPH8Q99549 860 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TUBA1CQ9BQE3 449 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CCDC106Q9BWC9 280 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 EDEM3Q9BZQ6 932 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ANKRD2Q9GZV1 360 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 FAM234AQ9H0X4 552 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TRPV6Q9H1D0 765 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PORCNQ9H237 461 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ACAD9Q9H845 621 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CRLF2Q9HC73 371 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 GJB4Q9NTQ9 266 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ABHD10Q9NUJ1 306 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 FKBP14Q9NWM8 211 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 MCM9Q9NXL9 1143 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 RRN3Q9NYV6 651 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 FNIP2Q9P278 1114 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 EXTL2Q9UBQ6 330 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TMED5Q9Y3A6 229 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF711Q9Y462 761 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 MROH5Q6ZUA9 1318 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 RFX7Q2KHR2 1363 aa3.09□□□□□ -1.92
ATXN3-211ENST00000511362 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
ATXN3-211ENST00000511362 CCDC69A6NI79 296 aa3.08□□□□□ -1.92
ATXN3-211ENST00000511362 CCDC169A6NNP5 214 aa3.08□□□□□ -1.92
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF814B7Z6K7 855 aa3.08□□□□□ -1.92
ATXN3-211ENST00000511362 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa3.08□□□□□ -1.92
ATXN3-211ENST00000511362 PRYO14603 147 aa3.08□□□□□ -1.92
ATXN3-211ENST00000511362 PMM2O15305 246 aa3.08□□□□□ -1.92
ATXN3-211ENST00000511362 NVLO15381 856 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
ATXN3-211ENST00000511362 YKT6O15498 198 aa3.08□□□□□ -1.92
ATXN3-211ENST00000511362 AHCYL1O43865 530 aa3.08□□□□□ -1.92
ATXN3-211ENST00000511362 CEP104O60308 925 aa3.08□□□□□ -1.92
ATXN3-211ENST00000511362 TSPAN3O60637 253 aa3.08□□□□□ -1.92
ATXN3-211ENST00000511362 UGDHO60701 494 aa3.08□□□□□ -1.92
ATXN3-211ENST00000511362 USO1O60763 962 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
ATXN3-211ENST00000511362 SLC22A3O75751 556 aa3.08□□□□□ -1.92
ATXN3-211ENST00000511362 NEBLO76041 1014 aa3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms