RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 LMO7DNF2Z398 122 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 SH3BP5O60239 455 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 SDC3O75056 442 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 CEACAM1P13688 526 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 XIAPP98170 497 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 GTF2H3Q13889 308 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 PTPRCAPQ14761 206 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 ANKRD22Q5VYY1 191 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 IZUMO3Q5VZ72 239 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 DOK6Q6PKX4 331 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF534Q76KX8 674 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 GATAD2AQ86YP4 633 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 GALNT13Q8IUC8 556 aa26.57■■□□□ 1.84
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SH3BP2-212ENST00000508338 SLC25A45Q8N413 288 aa26.57■■□□□ 1.84
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SH3BP2-212ENST00000508338 OR4C6Q8NH72 309 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 SNF8Q96H20 258 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 TTC25Q96NG3 672 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 SAMD15Q9P1V8 674 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 SUFUQ9UMX1 484 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 DOLKQ9UPQ8 538 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
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SH3BP2-212ENST00000508338 AGAP14A8MT82 685 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM63AO94886 807 aa26.56■■□□□ 1.84
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SH3BP2-212ENST00000508338 MC4RP32245 332 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 ID4P47928 161 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 TMPRSS15P98073 1019 aa26.56■■□□□ 1.84
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SH3BP2-212ENST00000508338 CACNG1Q06432 222 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 C2orf54Q08AI8 447 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC38Q502W7 563 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM74Q86UV6 250 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 GLMNQ92990 594 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 SGSM3Q96HU1 749 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 SERPINB12Q96P63 405 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 OR2M4Q96R27 311 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 TTC1Q99614 292 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 KIFC1Q9BW19 673 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 GSDMCQ9BYG8 508 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 RAB17Q9H0T7 212 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 CRLS1Q9UJA2 301 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 EFCAB8A8MWE9 144 aa26.55■■□□□ 1.84
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SH3BP2-212ENST00000508338 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 UCKL1Q9NWZ5 548 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 SOX13Q9UN79 622 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 CFAP99D6REC4 459 aa26.54■■□□□ 1.84
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SH3BP2-212ENST00000508338 CDK14O94921 469 aa26.54■■□□□ 1.84
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SH3BP2-212ENST00000508338 PYCR3Q53H96 274 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 EID2Q8N6I1 236 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM181AQ8N9Y4 354 aa26.54■■□□□ 1.84
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SH3BP2-212ENST00000508338 OR2AG1Q9H205 316 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 ATXN10Q9UBB4 475 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 FTSJ1Q9UET6 329 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 PCNX2A6NKB5 2137 aa26.54■■□□□ 1.84
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SH3BP2-212ENST00000508338 UGT1A9O60656 530 aa26.53■■□□□ 1.84
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SH3BP2-212ENST00000508338 PAMP19021 973 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 UGT1A6P19224 532 aa26.53■■□□□ 1.84
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SH3BP2-212ENST00000508338 UGT1A5P35504 534 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 MAGEA3P43357 314 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 POLD2P49005 469 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 GPRC6AQ5T6X5 926 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 CASC4Q6P4E1 433 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-212ENST00000508338 GLRX5Q86SX6 157 aa26.53■■□□□ 1.84
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