RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 IRX4P78413 519 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC34A1Q06495 639 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF33AQ06730 810 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 ITKQ08881 620 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC12A1Q13621 1099 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDH18Q13634 790 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 BLMHQ13867 455 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 SEPT6Q14141 434 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRPSAP1Q14558 356 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 INSCQ1MX18 579 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 MUM1Q2TAK8 710 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 PARP15Q460N3 678 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM182AQ5T1J6 154 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 MPP7Q5T2T1 576 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 GRTP1Q5TC63 336 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 MBLAC2Q68D91 279 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 CASC4Q6P4E1 433 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 SYCE2Q6PIF2 218 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 MTSS1LQ765P7 747 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHST9Q7L1S5 443 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 OTOP3Q7RTS5 596 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 PID1Q7Z2X4 250 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 TTC7BQ86TV6 843 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMPRSS6Q8IU80 811 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 BBS7Q8IWZ6 715 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 CPXM2Q8N436 756 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC33Q8N5R6 958 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIAA1958Q8N8K9 716 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 MFSD2AQ8NA29 543 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPFIBP2Q8ND30 876 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 BPIFB1Q8TDL5 484 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 DNAJC9Q8WXX5 260 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 FGF13Q92913 245 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATP2A3Q93084 1043 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGSF8Q969P0 613 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 P2RY11Q96G91 374 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 Q96M66 194 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZSWIM3Q96MP5 696 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 RILPQ96NA2 401 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 VAT1Q99536 393 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC106Q9BWC9 280 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 BBS2Q9BXC9 721 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC39A8Q9C0K1 460 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 NMUR2Q9GZQ4 415 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAGEH1Q9H213 219 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANLNQ9NQW6 1124 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 THAP1Q9NVV9 213 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 DNAJC28Q9NX36 388 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 SYBUQ9NX95 663 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 OBP2AQ9NY56 170 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 TAS2R1Q9NYW7 299 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 TXNDC16Q9P2K2 825 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF212Q9UDV6 495 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 STOML2Q9UJZ1 356 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRHDEQ9UKU6 1024 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM50BQ9Y247 325 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 OBSL1O75147 1896 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHD9Q3L8U1 2897 aa5.59□□□□□ -1.51
ARHGEF3-215ENST00000498517 DOCK4Q8N1I0 1966 aa5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 BAHCC1Q9P281 2608 aa5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ILVBLA1L0T0 632 aa5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 HEPACAM2A8MVW5 462 aa5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CAPN14A8MX76 684 aa5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 F5H423 210 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 F8W8V4 182 aa5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 I6L893 689 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 MATN3O15232 486 aa5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 PSMD3O43242 534 aa5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLIN3O60664 434 aa5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRT36O76013 467 aa5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 TM7SF2O76062 418 aa5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 NFATC1O95644 943 aa5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 JCHAINP01591 159 aa5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SERPINE1P05121 402 aa5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 MPOP05164 745 aa5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SERPINA6P08185 405 aa5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ITGA2BP08514 1039 aa5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 KITP10721 976 aa5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 LAMP2P13473 410 aa5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms