RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497230.2

PRRX1-207, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRX1, Length 3,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-207ENST00000497230 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SPEF1Q9Y4P9 236 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 GMPPBQ9Y5P6 360 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 EFCAB9A8MZ26 197 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 HACD1B0YJ81 288 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 MEN1O00255 615 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 MAFGO15525 162 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 SH3BGRLO75368 114 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 RASAL1O95294 804 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 CD4P01730 458 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 SLC2A4P14672 509 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ICAM3P32942 547 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 RFC2P35250 354 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 GRK3P35626 688 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 FOXA1P55317 472 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 CD83Q01151 205 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 CD47Q08722 323 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 DPYSL2Q16555 572 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 HFE2Q6ZVN8 426 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 TBL1YQ9BQ87 522 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 TKTL2Q9H0I9 626 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 CYP3A43Q9HB55 503 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 IL37Q9NZH6 218 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 TMEM9Q9P0T7 183 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ACTR3BQ9P1U1 418 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 OR12D3Q9UGF7 316 aa11.9□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 SMIM30A4D0T7 59 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 AQP12BA6NM10 295 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 MITFO75030 526 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 RFPL2O75678 378 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ALDH1A2O94788 518 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 TOMM70O94826 608 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 GUCA1CO95843 209 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 FYNP06241 537 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 POU4F1Q01851 419 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 BST2Q10589 180 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 TJAP1Q5JTD0 557 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 DET1Q7L5Y6 550 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 HIPK1Q86Z02 1210 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 AQP12AQ8IXF9 295 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 CCDC126Q96EE4 140 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 CSF3RQ99062 836 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 GPR22Q99680 433 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ULBP1Q9BZM6 244 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 DCSTAMPQ9H295 470 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 MAGEB16A2A368 324 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 BCKDKO14874 412 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 CNTN5O94779 1100 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 SEMA3DO95025 777 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 GPIP06744 558 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 SLC6A2P23975 617 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 NUDT6P53370 316 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 OR2B6P58173 313 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 PCID2Q5JVF3 399 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ARMCX2Q7L311 632 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 C11orf74Q86VG3 221 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 GALNT12Q8IXK2 581 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 FBXO39Q8N4B4 442 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 STON2Q8WXE9 905 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 TSPAN17Q96FV3 270 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 KLHL5Q96PQ7 755 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 SLC30A3Q99726 388 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 OSBPL2Q9H1P3 480 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 TNKS2Q9H2K2 1166 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 FAM8A1Q9UBU6 413 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ENPP3O14638 875 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 SLC22A3O75751 556 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 RGS20O76081 388 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 CSF2P04141 144 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 HMBSP08397 361 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 SNX17Q15036 470 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 OXA1LQ15070 435 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 PRMT9Q6P2P2 845 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 PKN3Q6P5Z2 889 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 PDPRQ8NCN5 879 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 C7orf57Q8NEG2 295 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 BEST2Q8NFU1 509 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 EGFL8Q99944 293 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ACTR8Q9H981 624 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 C3orf18Q9UK00 162 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 CDH9Q9ULB4 789 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 KLHL20Q9Y2M5 609 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 VWA7Q9Y334 891 aa11.89□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ATAD5Q96QE3 1844 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 MSI1O43347 362 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ANXA6P08133 673 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 PWP1Q13610 501 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 PAGE3Q5JUK9 113 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 STEAP4Q687X5 459 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 IL27RAQ6UWB1 636 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms