RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HCRTR2O43614 444 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGF17O60258 216 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC25A12O75746 678 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANOS1P23352 680 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TIMP3P35625 211 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NIPAL4Q0D2K0 466 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADIPOQQ15848 244 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYLK3Q32MK0 819 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTCAP3Q53RY4 240 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRIF1Q5T3J3 769 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC70Q6NSX1 233 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXL22Q6P050 247 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAD9BQ6WBX8 426 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF852Q6ZMS4 543 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR180Q86V85 440 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FRMD1Q8N878 549 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DMBX1Q8NFW5 382 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM255BQ8WV15 326 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC44A1Q8WWI5 657 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EGLN2Q96KS0 407 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAGIXQ9H6Y5 334 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FKRPQ9H9S5 495 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IRAK4Q9NWZ3 460 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTMR10Q9NXD2 777 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HS3ST1O14792 307 aa4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNK5O95279 499 aa4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ICAM1P05362 532 aa4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM106CPP0CH98 169 aa4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHEXP78562 749 aa4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZBED6P86452 979 aa4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MED22Q15528 200 aa4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM35AQ53FP2 167 aa4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF805Q5CZA5 627 aa4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCTD8Q6ZWB6 473 aa4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PXKQ7Z7A4 578 aa4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAP7D3Q8IWC1 876 aa4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC24A4Q8NFF2 622 aa4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SGCDQ92629 289 aa4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALG14Q96F25 216 aa4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NEURL2Q9BR09 285 aa4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIGMQ9H3S5 423 aa4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAAR2Q9P1P5 351 aa4.35□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C5orf60A6NFR6 353 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LIPT2A6NK58 231 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DAB1O75553 588 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC22A3O75751 556 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCNDBP1O95273 360 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NR1D1P20393 614 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRCPP42785 496 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GLIPR1P48060 266 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MMP14P50281 582 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAS2R40P59535 323 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COG7P83436 770 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDC16Q13042 620 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR7E24Q6IFN5 339 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM171BQ6P995 826 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NCEH1Q6PIU2 408 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q75L30 129 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSPAN33Q86UF1 283 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR1J2Q8NGS2 313 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR52I2Q8NH67 350 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HM13Q8TCT9 377 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC8CQ8TDW0 803 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MUC13Q9H3R2 512 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EHD2Q9NZN4 543 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AASSQ9UDR5 926 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STK39Q9UEW8 545 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRAG1Q86YV5 1406 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP4.33□□□□□ -1.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NDUFS3O75489 264 aa4.33□□□□□ -1.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DDX58O95786 925 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GM2AP17900 193 aa4.33□□□□□ -1.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms