RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489977.5

SKAP2-206, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 679 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-206ENST00000489977 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa3.4□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa3.4□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 RASAL2Q9UJF2 1139 aa3.4□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 A0A0G2JLW4 131 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 ARHGEF9O43307 516 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 GUCY1B2O75343 617 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 CAVIN2O95810 425 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 VAMP2P63027 116 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 PLIN5Q00G26 463 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 TLE2Q04725 743 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 GRIK2Q13002 908 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 USP41Q3LFD5 358 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 DCST1Q5T197 706 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 SIGIRRQ6IA17 410 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 LRRC8DQ7L1W4 858 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 ATG9AQ7Z3C6 839 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 ZNF440Q8IYI8 595 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 MYRIPQ8NFW9 859 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 KLHL15Q96M94 604 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 UBXN6Q9BZV1 441 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 TRIM15Q9C019 465 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 WDR13Q9H1Z4 485 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 RPS10P5Q9NQ39 176 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 ADPRHL2Q9NX46 363 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 SLC13A4Q9UKG4 626 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 DGKBQ9Y6T7 804 aa3.39□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 A0A0J9YWU9 116 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 A0A1W2PP11 408 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 A0A1W2PPI3 338 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 NDUFAF8A1L188 74 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 OR5K3A6NET4 321 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 LDLRAD4O15165 306 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 HOXB5P09067 269 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 COX7A2P14406 83 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 CSF2RAP15509 400 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 MAP2K2P36507 400 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 GNAQP50148 359 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 CSRP3P50461 194 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 BIRC3Q13489 604 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 KIR2DS3Q14952 304 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 ALG11Q2TAA5 492 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 COL28A1Q2UY09 1125 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 PLXDC2Q6UX71 529 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 CYP26C1Q6V0L0 522 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 GPR180Q86V85 440 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 HERVK_113Q902F9 699 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 PPCSQ9HAB8 311 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 LTB4R2Q9NPC1 389 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 TMEM181Q9P2C4 612 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 FBXL2Q9UKC9 423 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 GJD2Q9UKL4 321 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 UTYO14607 1347 aa3.38□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 FAM90A26D6RGX4 464 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 NBNO60934 754 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 UGT1A1P22309 533 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 NR2C2P49116 596 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 UBE3AQ05086 875 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 KRTCAP3Q53RY4 240 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 ZNF790Q6PG37 636 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 RRM2BQ7LG56 351 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 PHF21AQ96BD5 680 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 ZBTB10Q96DT7 871 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 ACOX2Q99424 681 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 FUZQ9BT04 418 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 LRMDAQ9H2I8 198 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 RIC8AQ9NPQ8 531 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 KLHL9Q9P2J3 617 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 ZNF69Q9UC07 566 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 JRKLQ9Y4A0 524 aa3.37□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 A0A1W2PQM1 296 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 DUXAA6NLW8 204 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 USP17L23D6RBM5 183 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 H7C423 109 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 ANKRD28O15084 1053 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 KCNN4O15554 427 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 WISP2O76076 250 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 MLYCDO95822 493 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 CEACAM1P13688 526 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 DPEP1P16444 411 aa3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms