RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 GRID1Q9ULK0 1009 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 FZD4Q9ULV1 537 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 ACOT9Q9Y305 439 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 VWA7Q9Y334 891 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 FADS2P1A8MWK0 482 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 C10orf142B7Z368 130 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 H3BMM5 538 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 OR1I1O60431 355 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 PLIN3O60664 434 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 KLHL2O95198 593 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 SOD1P00441 154 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 DNTTP04053 509 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 PROCP04070 461 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 LSP1P33241 339 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 NSG1P42857 185 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 SLC12A2P55011 1212 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 GNGT1P63211 74 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 IL9RQ01113 521 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 LRRC32Q14392 662 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF460Q14592 562 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 PDK4Q16654 411 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF284Q2VY69 593 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 CCDC153Q494R4 210 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 MACC1Q6ZN28 852 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 TAS2R42Q7RTR8 314 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 KBTBD6Q86V97 674 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 TMPRSS6Q8IU80 811 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 CKAP2Q8WWK9 683 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 SCAMP4Q969E2 229 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 NUS1Q96E22 293 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 MAGEB18Q96M61 343 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 GPR78Q96P69 363 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 FAM111AQ96PZ2 611 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 VPS11Q9H270 941 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 CCDC68Q9H2F9 335 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM216Q9P0N5 145 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 GNPTGQ9UJJ9 305 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 TLK1Q9UKI8 766 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 ATG2BQ96BY7 2078 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 A0A1W2PP55 124 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 BIRC5O15392 142 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 VPS26AO75436 327 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 APOA4P06727 396 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 UGT1A6P19224 532 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 UGT1A1P22309 533 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 UGT1A4P22310 534 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 TARSP26639 723 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 TEAD1P28347 426 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 FMO4P31512 558 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 UGT1A3P35503 534 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 UGT1A5P35504 534 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 SERPINB4P48594 390 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 B4GALNT1Q00973 533 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 DLG1Q12959 904 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 FZD5Q13467 585 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 LRRC14Q15048 493 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 ACOX1Q15067 660 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 CRY1Q16526 586 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 GPRC6AQ5T6X5 926 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM207Q6UWW9 146 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM92Q6UXU6 159 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 RAPH1Q70E73 1250 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 PIM3Q86V86 326 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM151AQ8N4L1 468 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 HDDC3Q8N4P3 179 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 RDH11Q8TC12 318 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 CD200R1Q8TD46 325 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 MGARPQ8TDB4 240 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 CXorf40AQ8TE69 158 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 HEXDCQ8WVB3 486 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 AP2M1Q96CW1 435 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 MRGPRX1Q96LB2 322 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 COPS8Q99627 209 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 BOCQ9BWV1 1114 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 SPATA16Q9BXB7 569 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 SLC13A1Q9BZW2 595 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 GPAMQ9HCL2 828 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 MLXIPLQ9NP71 852 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 LTB4R2Q9NPC1 389 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 LATS2Q9NRM7 1088 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 IGSF5Q9NSI5 407 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf3-220ENST00000489318 TAS2R13Q9NYV9 303 aa11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms