RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, human

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCL20-204	ENST00000489160	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCL20-204	ENST00000489160	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCL20-204	ENST00000489160	TEX12	Q9BXU0	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCL20-204	ENST00000489160	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCL20-204	ENST00000489160	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCL20-204	ENST00000489160	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCL20-204	ENST00000489160	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCL20-204	ENST00000489160	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCL20-204	ENST00000489160	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	PSMA7	O14818	248 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	OGG1	O15527	345 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	EGF	P01133	1207 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	PRSS2	P07478	247 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	CTF1	Q16619	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	POC5	Q8NA72	575 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	WASF1	Q92558	559 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	RND1	Q92730	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	EGLN2	Q96KS0	407 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	GBP5	Q96PP8	586 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	COPG2	Q9UBF2	871 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	MTRR	Q9UBK8	725 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	TINAG	Q9UJW2	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160		M0QZ24	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	SOCS6	O14544	535 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	CTDSP2	O14595	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	MAP2K7	O14733	419 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	SPINT2	O43291	252 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	PGM3	O95394	542 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	QDPR	P09417	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	TGFB3	P10600	412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	ATP5D	P30049	168 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	BDKRB2	P30411	391 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	FASLG	P48023	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	GPR143	P51810	404 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	EGR4	Q05215	589 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	FOXM1	Q08050	763 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	HLF	Q16534	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	NTRK2	Q16620	822 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	DCST1	Q5T197	706 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	APBB2	Q92870	758 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	DESI2	Q9BSY9	194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	PIGM	Q9H3S5	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CCL20-204	ENST00000489160	ENTPD3	O75355	529 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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