RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 GKN2Q86XP6 184 aa6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 RFX6Q8HWS3 928 aa6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 PELI3Q8N2H9 469 aa6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 OR56A4Q8NGH8 313 aa6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ARRDC2Q8TBH0 407 aa6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.4□□□□□ -1.38
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CTDSPL-208ENST00000486978 NAT6Q93015 286 aa6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.4□□□□□ -1.38
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CTDSPL-208ENST00000486978 OLFM3Q96PB7 478 aa6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.4□□□□□ -1.38
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CTDSPL-208ENST00000486978 FGF22Q9HCT0 170 aa6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.4□□□□□ -1.38
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CTDSPL-208ENST00000486978 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 PCSK5Q92824 1860 aa6.4□□□□□ -1.39
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CTDSPL-208ENST00000486978 PRSS38A1L453 326 aa6.39□□□□□ -1.39
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CTDSPL-208ENST00000486978 TCEA3O75764 348 aa6.39□□□□□ -1.39
CTDSPL-208ENST00000486978 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
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CTDSPL-208ENST00000486978 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CTDSPL-208ENST00000486978 TEAD1P28347 426 aa6.39□□□□□ -1.39
CTDSPL-208ENST00000486978 CD86P42081 329 aa6.39□□□□□ -1.39
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CTDSPL-208ENST00000486978 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
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CTDSPL-208ENST00000486978 SEPT10Q9P0V9 454 aa6.39□□□□□ -1.39
CTDSPL-208ENST00000486978 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.39□□□□□ -1.39
CTDSPL-208ENST00000486978 PADI4Q9UM07 663 aa6.39□□□□□ -1.39
CTDSPL-208ENST00000486978 TFR2Q9UP52 801 aa6.39□□□□□ -1.39
CTDSPL-208ENST00000486978 GPR34Q9UPC5 381 aa6.39□□□□□ -1.39
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