RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 CAMK2BQ13554 666 aa20.74■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 CHRNA6Q15825 494 aa20.74■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 CDCP2Q5VXM1 449 aa20.74■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 FAM151BQ6UXP7 276 aa20.74■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa20.74■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 NAT6Q93015 286 aa20.74■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 PBKQ96KB5 322 aa20.74■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa20.74■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 B4DGG1 531 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 UGT1A9O60656 530 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 MT-CO3P00414 261 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 TPH1P17752 444 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 UGT1A6P19224 532 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 UGT1A1P22309 533 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 UGT1A4P22310 534 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 UGT1A3P35503 534 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 UGT1A5P35504 534 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 FDFT1P37268 417 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 KCNJ1P48048 391 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 LRP8Q14114 963 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 SLC30A9Q6PML9 568 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 PRELID2Q8N945 189 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 OR4K2Q8NGD2 314 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 MAPK15Q8TD08 544 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 UGT1A7Q9HAW7 530 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 UGT1A10Q9HAW8 530 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 UGT1A8Q9HAW9 530 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 RABGEF1Q9UJ41 708 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 PYCARDQ9ULZ3 195 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 CHUKO15111 745 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 CASC3O15234 703 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 GRID2O43424 1007 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 LDB2O43679 373 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 KIF5CO60282 957 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 MTX2O75431 263 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 CRTAMO95727 393 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 ACTN2P35609 894 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 ACTR1BP42025 376 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 ACTR1AP61163 376 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 SEMA5AQ13591 1074 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 C14orf28Q4W4Y0 310 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 CCDC89Q8N998 374 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 OR6C4Q8NGE1 309 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 OR13C4Q8NGS5 318 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 MS4A14Q96JA4 679 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 HOMER3Q9NSC5 361 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
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ACTB-211ENST00000480301 FKBPLQ9UIM3 349 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 RP1P56715 2156 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 GPR89AB7ZAQ6 455 aa20.71■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 GPR39O43194 453 aa20.71■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 SUN1O94901 812 aa20.71■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 GPR89BP0CG08 455 aa20.71■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 XIAPP98170 497 aa20.71■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 PDE1BQ01064 536 aa20.71■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 CERCAMQ5T4B2 595 aa20.71■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 LINC00523Q86TU6 105 aa20.71■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 NAGSQ8N159 534 aa20.71■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.71■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 CCDC74AQ96AQ1 378 aa20.71■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 C19orf43Q9BQ61 176 aa20.71■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 CCDC3Q9BQI4 270 aa20.71■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 ABCG4Q9H172 646 aa20.71■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.71■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 CLCA2Q9UQC9 943 aa20.71■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 VEGFDO43915 354 aa20.7■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 CDK14O94921 469 aa20.7■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 ACP5P13686 325 aa20.7■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 MAZP56270 477 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 PEX6Q13608 980 aa20.7■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 ITGA9Q13797 1035 aa20.7■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 OR52K1Q8NGK4 314 aa20.7■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 ZNF398Q8TD17 642 aa20.7■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 COG1Q8WTW3 980 aa20.7■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 PATE1Q8WXA2 126 aa20.7■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.7■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 RNF215Q9Y6U7 377 aa20.7■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 SRP72O76094 671 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEF1O95521 474 aa20.69■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 ECEL1O95672 775 aa20.69■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 PROS1P07225 676 aa20.69■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 GLB1P16278 677 aa20.69■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 GRIA1P42261 906 aa20.69■□□□□ 0.9
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